138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2455 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
919 aa  1787    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.45 
 
 
1227 aa  439  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.58 
 
 
972 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  40.56 
 
 
1119 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.35 
 
 
1029 aa  354  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  36.41 
 
 
1519 aa  342  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  40.79 
 
 
2003 aa  328  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  38.29 
 
 
1001 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  37.48 
 
 
995 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  34.78 
 
 
650 aa  307  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  36.69 
 
 
986 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.67 
 
 
1011 aa  294  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  36.51 
 
 
1001 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  34.77 
 
 
991 aa  281  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  35.56 
 
 
995 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33.44 
 
 
1550 aa  280  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  36.15 
 
 
3506 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  35.24 
 
 
983 aa  268  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.66 
 
 
1285 aa  267  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  37.02 
 
 
2365 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  37.02 
 
 
2346 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  35.91 
 
 
1004 aa  261  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  34.98 
 
 
1055 aa  260  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.24 
 
 
1038 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  37.19 
 
 
1508 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  38.83 
 
 
1130 aa  258  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  40.37 
 
 
1129 aa  257  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  35.41 
 
 
1028 aa  257  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  40.37 
 
 
1131 aa  257  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  40.16 
 
 
1129 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.08 
 
 
1848 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  40.16 
 
 
1131 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  40.16 
 
 
1131 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  40.16 
 
 
1131 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  34.31 
 
 
1033 aa  255  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  37.36 
 
 
2396 aa  254  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  32.26 
 
 
1881 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  40.57 
 
 
1131 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  34.38 
 
 
2371 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  33.09 
 
 
990 aa  244  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  34.21 
 
 
2366 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  32.34 
 
 
1333 aa  239  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  34.71 
 
 
1782 aa  234  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.95 
 
 
1125 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  34.01 
 
 
4238 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.01 
 
 
4238 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  34.01 
 
 
3822 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  35.53 
 
 
1056 aa  214  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  34.02 
 
 
677 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  35.92 
 
 
1016 aa  210  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 
1062 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.94 
 
 
3954 aa  207  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  31.31 
 
 
1164 aa  205  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  34.95 
 
 
1053 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  30.16 
 
 
1006 aa  190  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1152 aa  188  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.14 
 
 
985 aa  183  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.28 
 
 
1011 aa  172  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  31.99 
 
 
994 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.36 
 
 
2711 aa  165  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  30.96 
 
 
980 aa  165  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.17 
 
 
3629 aa  130  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  28.8 
 
 
407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  33.82 
 
 
488 aa  129  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.59 
 
 
1489 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.07 
 
 
1081 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.85 
 
 
1769 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  31.18 
 
 
1459 aa  109  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  28.78 
 
 
1180 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  31.05 
 
 
1458 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.2 
 
 
816 aa  103  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  27.24 
 
 
882 aa  98.2  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.61 
 
 
814 aa  97.8  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.43 
 
 
1532 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.52 
 
 
1066 aa  90.9  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  28.05 
 
 
1111 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.92 
 
 
915 aa  88.6  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.98 
 
 
1322 aa  88.6  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  27.2 
 
 
942 aa  89  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25.2 
 
 
1369 aa  88.6  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  26.04 
 
 
1130 aa  88.2  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  27.35 
 
 
1025 aa  88.6  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  27.86 
 
 
311 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  24.68 
 
 
2407 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.37 
 
 
774 aa  84.7  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.44 
 
 
913 aa  82.4  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.77 
 
 
926 aa  81.6  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.38 
 
 
1177 aa  76.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.52 
 
 
972 aa  73.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.2 
 
 
910 aa  73.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  42.86 
 
 
2926 aa  72.4  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  32.03 
 
 
1327 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  32.47 
 
 
1327 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  38.68 
 
 
145 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  26.35 
 
 
909 aa  69.7  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  26.74 
 
 
959 aa  70.1  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  32.92 
 
 
987 aa  68.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.78 
 
 
965 aa  67.4  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  28.15 
 
 
970 aa  66.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.35 
 
 
1012 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>