195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2380 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  88.52 
 
 		 209 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  86.6 
 
 		 209 aa  358  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  76.08 
 
 		 209 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  67.79 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  65.55 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  68.93 
 
 		 208 aa  268  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  63.64 
 
 		 209 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  63.16 
 
 		 209 aa  267  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  68.45 
 
 		 208 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  67.96 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  67.94 
 
 		 209 aa  264  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  66.5 
 
 		 208 aa  264  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  64.11 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  64.25 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  65.7 
 
 		 230 aa  261  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  65.85 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  65.38 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  66.51 
 
 		 209 aa  258  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  66.51 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  66.67 
 
 		 210 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  68.93 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  66.03 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  65.2 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  66.34 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  66.18 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  69.76 
 
 		 210 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  65.87 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 		 208 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  68.29 
 
 		 210 aa  245  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  63.85 
 
 		 221 aa  244  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  66.67 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  65.22 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  64.25 
 
 		 210 aa  240  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  66.02 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  60.85 
 
 		 220 aa  238  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  63.29 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  65.53 
 
 		 208 aa  237  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  66.02 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  67.15 
 
 		 208 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 212 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  68.45 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26500  precorrin-8X methylmutase  68.45 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00589849  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  63.4 
 
 		 512 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 		 732 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  63.11 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  63.29 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  64.25 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  56.73 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  61.32 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  62.62 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 		 209 aa  219  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  60.29 
 
 		 215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  63.81 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  59.9 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  65.7 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1162  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00824413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0802  Precorrin-8X methylmutase  62.5 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1603  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0265  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.187916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0895  precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.182747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  60.39 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  55.34 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2480  Precorrin-8X methylmutase  61.14 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  61.03 
 
 		 499 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 		 208 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 		 208 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  61.17 
 
 		 208 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2422  precorrin-8X methylmutase  63.54 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230932  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  56.52 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  47.29 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.65 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.08 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  43.28 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  46.27 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  42.52 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.81 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.08 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  42.42 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  40.74 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.31 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.5 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.45 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.18 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.59 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>