253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2373 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2373  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
453 aa  904    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.26 
 
 
453 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2313  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  84.07 
 
 
453 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.85 
 
 
441 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2541  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.42 
 
 
429 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3154  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.81 
 
 
446 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.32 
 
 
441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.551966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0333  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.97 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.32 
 
 
441 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.34 
 
 
438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.748886  normal  0.0205845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2159  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.09 
 
 
441 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2219  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.12 
 
 
438 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.867959  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.82 
 
 
441 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.59 
 
 
441 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0766234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.97 
 
 
441 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.72 
 
 
447 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1040  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.82 
 
 
441 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0318758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0970  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.5 
 
 
441 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.88 
 
 
445 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.445117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3124  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.66 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3518  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.05 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.19647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3359  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.82 
 
 
460 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.72 
 
 
431 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198297  normal  0.0303559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.97 
 
 
429 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_004310  BR1296  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.91 
 
 
436 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1889  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.11 
 
 
436 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.659609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2123  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.07 
 
 
435 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226797  hitchhiker  0.00769752 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.68 
 
 
436 aa  359  6e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.913176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.95 
 
 
436 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0244195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2623  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.3 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0367802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.26 
 
 
450 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.23 
 
 
464 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.39 
 
 
464 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.72 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.39 
 
 
480 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4184  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.04 
 
 
460 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0574  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.53 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.44 
 
 
464 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0224312  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0470  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.59 
 
 
462 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1001  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.73 
 
 
467 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0243  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.53 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.59 
 
 
454 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 
488 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.6 
 
 
465 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000497962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.62 
 
 
458 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09381  putative cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.41 
 
 
475 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101452 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.66 
 
 
441 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.328334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4466  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.73 
 
 
430 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.360132  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0635  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.04 
 
 
467 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873806  normal  0.509374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0926  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.37 
 
 
482 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.47 
 
 
454 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2119  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.47 
 
 
455 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0264172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2056  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.47 
 
 
455 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2890  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.55 
 
 
463 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_135  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.63 
 
 
463 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.49 
 
 
463 aa  249  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0079  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 
450 aa  249  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.786214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1272  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.2 
 
 
431 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0896516  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1673  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.2 
 
 
431 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.637615  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1187  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  38.11 
 
 
439 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2254  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.45 
 
 
538 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3894  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.45 
 
 
460 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0538501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4046  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.97 
 
 
431 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1642  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.3 
 
 
431 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2191  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  35.2 
 
 
452 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2707  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.39 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3750  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.23 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5883  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.24 
 
 
478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00172766  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0437  cobrinic acid a,c-diamide synthase  41.57 
 
 
442 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0472  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  41.57 
 
 
442 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.46 
 
 
510 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.82 
 
 
460 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1850  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.05 
 
 
454 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1709  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  39.13 
 
 
431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1429  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  36.77 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1232  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.05 
 
 
431 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.75 
 
 
465 aa  239  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 
460 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0277  glutamine amidotransferase  38.27 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.82 
 
 
475 aa  239  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0327  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.8 
 
 
440 aa  239  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.580612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.27 
 
 
431 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629606 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0078  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.92 
 
 
469 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5366  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.85 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2136  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.38 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.61 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0481  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.09 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1628  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  39.65 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000140301  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0544  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42 
 
 
461 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.54 
 
 
455 aa  233  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.14 
 
 
452 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00158406  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2297  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.04 
 
 
557 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368045  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47760  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.73 
 
 
435 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302792  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0036  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.45 
 
 
460 aa  232  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.73 
 
 
443 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0220  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.42 
 
 
447 aa  229  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3379  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.7 
 
 
443 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.18716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2158  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  36.06 
 
 
439 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3196  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.35 
 
 
475 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>