32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2244 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  266  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  80.92 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  79.55 
 
 		 132 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  82.93 
 
 		 132 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  47.76 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  46.88 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  37.23 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  37.88 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  36.3 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  31.91 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  33.57 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  32.87 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  32.87 
 
 		 163 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  33.33 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  32.85 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  32.85 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  33.94 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  30.43 
 
 		 148 aa  48.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  33.59 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  32.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  29.25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  29.35 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  30.43 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  31.52 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  30.22 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>