More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2216 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  64.59 
 
 		 672 aa  815    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  61.24 
 
 		 625 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  67.59 
 
 		 663 aa  845    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  60.06 
 
 		 628 aa  753    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  56.35 
 
 		 610 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  67.49 
 
 		 647 aa  835    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  64.23 
 
 		 672 aa  809    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  65.91 
 
 		 640 aa  829    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  68.14 
 
 		 644 aa  845    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  65.46 
 
 		 655 aa  842    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  80.09 
 
 		 652 aa  1058    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  54.07 
 
 		 607 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  56.14 
 
 		 612 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  61.4 
 
 		 625 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  59.49 
 
 		 646 aa  737    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  55.21 
 
 		 617 aa  661    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  89.62 
 
 		 655 aa  1216    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0722  ABC transporter related  62.02 
 
 		 627 aa  733    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  76.84 
 
 		 657 aa  1014    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  54.81 
 
 		 624 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.34 
 
 		 627 aa  729    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  81.39 
 
 		 661 aa  1087    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  89.4 
 
 		 651 aa  1175    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  55.97 
 
 		 612 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  80.95 
 
 		 652 aa  1042    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  56.73 
 
 		 606 aa  666    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  70.64 
 
 		 654 aa  843    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  62.75 
 
 		 626 aa  759    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  56.97 
 
 		 611 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.59 
 
 		 628 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.06 
 
 		 625 aa  752    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  100 
 
 		 651 aa  1328    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  62.02 
 
 		 628 aa  758    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  67.04 
 
 		 662 aa  849    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  55.01 
 
 		 603 aa  631  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  53.03 
 
 		 609 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  55.01 
 
 		 603 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 		 592 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  51.28 
 
 		 596 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  52.09 
 
 		 629 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  51.28 
 
 		 631 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  51.28 
 
 		 596 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 593 aa  617  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  51.29 
 
 		 622 aa  615  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  51.86 
 
 		 589 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  51.93 
 
 		 612 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  51.75 
 
 		 612 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  51.43 
 
 		 608 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  53.12 
 
 		 630 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  51.78 
 
 		 607 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  52.25 
 
 		 625 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  51.1 
 
 		 605 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  51.34 
 
 		 606 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  50.85 
 
 		 607 aa  598  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  51.05 
 
 		 623 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  51.57 
 
 		 637 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.19 
 
 		 651 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  51.52 
 
 		 606 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  52.02 
 
 		 623 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  51.85 
 
 		 623 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  51.85 
 
 		 623 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  52.11 
 
 		 621 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  52.63 
 
 		 621 aa  591  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  51.22 
 
 		 604 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  50.96 
 
 		 619 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  50.49 
 
 		 656 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  50.43 
 
 		 598 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  52.55 
 
 		 590 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.02 
 
 		 623 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.02 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.02 
 
 		 623 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  51.25 
 
 		 629 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  52.02 
 
 		 654 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.02 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.02 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  52.02 
 
 		 623 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  50.32 
 
 		 631 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  52.7 
 
 		 624 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  50.17 
 
 		 591 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  51.68 
 
 		 623 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  49.76 
 
 		 623 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  50.25 
 
 		 606 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  50 
 
 		 608 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  49.4 
 
 		 590 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  48.92 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  49.59 
 
 		 623 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01920  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  46.99 
 
 		 734 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  49.51 
 
 		 615 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 603 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  51.02 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2340  ABC transporter related  51.18 
 
 		 604 aa  570  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  48.46 
 
 		 591 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  49.66 
 
 		 595 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  48.01 
 
 		 577 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  48.89 
 
 		 597 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 591 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  49.23 
 
 		 598 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  51.53 
 
 		 619 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  48.89 
 
 		 596 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  45.16 
 
 		 652 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>