More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2154 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  75 
 
 
437 aa  651  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  75.72 
 
 
437 aa  658  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
430 aa  860  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  82.05 
 
 
429 aa  730  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  75.66 
 
 
437 aa  650  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  65.69 
 
 
424 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  66.42 
 
 
425 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  65.92 
 
 
441 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  65.85 
 
 
436 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  65.85 
 
 
432 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  63.04 
 
 
441 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  65.5 
 
 
424 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  63.2 
 
 
436 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  59.53 
 
 
436 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  59.53 
 
 
436 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  59.53 
 
 
436 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  60.64 
 
 
437 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  60.64 
 
 
437 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  59.26 
 
 
439 aa  469  1e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  60.49 
 
 
419 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 
441 aa  452  1e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  55.56 
 
 
429 aa  438  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  54.03 
 
 
447 aa  438  1e-122  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  62.01 
 
 
446 aa  439  1e-122  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  55.56 
 
 
429 aa  438  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  55.66 
 
 
428 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  53.81 
 
 
433 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  55.83 
 
 
438 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  53.43 
 
 
432 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  53.22 
 
 
431 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  56.53 
 
 
441 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  54.17 
 
 
432 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  53.43 
 
 
432 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  58.02 
 
 
441 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  52.38 
 
 
443 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  57.78 
 
 
441 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  53.28 
 
 
444 aa  408  1e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  54.23 
 
 
439 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  50.35 
 
 
438 aa  399  1e-110  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  53.52 
 
 
450 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 
428 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  50.59 
 
 
443 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  52.21 
 
 
447 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  56.13 
 
 
428 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  51.33 
 
 
447 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  52.45 
 
 
446 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 
443 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  50.86 
 
 
417 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 
429 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
430 aa  327  2e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  43.07 
 
 
430 aa  327  2e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  40.71 
 
 
422 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  39.76 
 
 
438 aa  287  3e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  2.66277e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  36.29 
 
 
431 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  39.76 
 
 
421 aa  254  1e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.58 
 
 
430 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.7 
 
 
412 aa  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
436 aa  148  2e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
408 aa  147  2e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
425 aa  142  1e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
416 aa  142  2e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.26 
 
 
418 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.12 
 
 
418 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.1 
 
 
411 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
416 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  30.33 
 
 
391 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.43521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  28.64 
 
 
412 aa  134  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  28.39 
 
 
410 aa  130  5e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
407 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
415 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  28.57 
 
 
380 aa  126  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  25.98 
 
 
402 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.98 
 
 
402 aa  126  8e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.11684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  29.91 
 
 
454 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  28.37 
 
 
382 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  29.29 
 
 
455 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.14 
 
 
402 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.46 
 
 
402 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21238e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.46 
 
 
402 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.15 
 
 
442 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.72 
 
 
402 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83174e-08 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.46 
 
 
402 aa  122  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.46 
 
 
402 aa  122  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
405 aa  121  2e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.2 
 
 
402 aa  121  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
421 aa  122  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.01 
 
 
412 aa  120  5e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
421 aa  120  5e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  24.93 
 
 
402 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
421 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.01 
 
 
421 aa  119  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  27.57 
 
 
379 aa  118  2e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
407 aa  118  2e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
398 aa  117  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
398 aa  117  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
398 aa  117  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.15 
 
 
408 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  24.58 
 
 
398 aa  115  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
434 aa  115  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  26.88 
 
 
397 aa  115  1e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>