More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2140 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  74.1 
 
 		 527 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  71.12 
 
 		 516 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  79.85 
 
 		 528 aa  790    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  100 
 
 		 523 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  77.69 
 
 		 528 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  81.82 
 
 		 526 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  71.54 
 
 		 523 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  56.95 
 
 		 520 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  59.28 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  51.42 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  54.55 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  53.02 
 
 		 537 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  53.53 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  54.12 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  53.42 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  49.25 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  53.11 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  52.17 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  53.78 
 
 		 496 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  52.17 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  51.24 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  51.24 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  53.57 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  53.04 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  47.42 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  46.83 
 
 		 527 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  49.49 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  44.11 
 
 		 517 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  47.89 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  47.22 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  50.36 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  48.24 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  48.46 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  45.7 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  45.37 
 
 		 487 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  42.67 
 
 		 514 aa  358  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.5 
 
 		 506 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  43.92 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.7 
 
 		 535 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.92 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  43.25 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  40.3 
 
 		 508 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  44.35 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  44.02 
 
 		 496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.14 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.98 
 
 		 501 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.7 
 
 		 508 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.32 
 
 		 464 aa  330  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.08 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  42.3 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.33 
 
 		 476 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  43.71 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  42.24 
 
 		 578 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.83 
 
 		 511 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.69 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.18 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.77 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.95 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  42.12 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.32 
 
 		 522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.49 
 
 		 500 aa  320  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41.21 
 
 		 471 aa  319  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  45.06 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  42.36 
 
 		 523 aa  317  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  46.65 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  43.35 
 
 		 497 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  43.99 
 
 		 511 aa  316  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  43.99 
 
 		 511 aa  316  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.46 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.7 
 
 		 462 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  48.11 
 
 		 524 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  44.73 
 
 		 499 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  42.71 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.14 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  41.01 
 
 		 524 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.03 
 
 		 472 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.2 
 
 		 520 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.04 
 
 		 475 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.58 
 
 		 503 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  41.98 
 
 		 505 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.81 
 
 		 524 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  41.42 
 
 		 516 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.32 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.17 
 
 		 518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  40.82 
 
 		 485 aa  303  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  40.55 
 
 		 459 aa  303  7.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  40.66 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  40.2 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  41.56 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.25 
 
 		 476 aa  299  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.8 
 
 		 476 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.52 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  42.14 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.04 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.78 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.78 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.78 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.78 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.78 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.78 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>