More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2044 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  77.82 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  82.95 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  75.09 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  74.14 
 
 		 294 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  71.81 
 
 		 292 aa  377  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  70.68 
 
 		 285 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  53.33 
 
 		 257 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  54.72 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  53.17 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  55.91 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  47.73 
 
 		 274 aa  242  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  49.21 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  57.87 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  55.64 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  55.12 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  44 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  47.83 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.43 
 
 		 400 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  45.24 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  48.81 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  49.22 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  49.04 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  47.57 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.62 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.62 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 277 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 274 aa  215  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 		 397 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 		 412 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  42.19 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  42.19 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  44.05 
 
 		 399 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  48.35 
 
 		 303 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  45.8 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 		 279 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  45.69 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  40.57 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  43.91 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  46.25 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  44.61 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  46.9 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.75 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  37.96 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1412  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  44.79 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  44.12 
 
 		 817 aa  191  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  47.66 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  46.37 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  45.31 
 
 		 810 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  40.68 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  47.18 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  47.94 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  45.97 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  44.78 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  44.05 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>