56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2038 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1759  prevent-host-death protein  47.19 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.141963 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  62.07 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3054  prevent-host-death family protein  53.03 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.326995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  72.22 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3775  prevent-host-death family protein  45.12 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  44.78 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  41.98 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  39.78 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  46.55 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  46.55 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  40.45 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  41.56 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1670  prevent-host-death family protein  51.16 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  61.54 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  43.86 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  52.08 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  61.11 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  61.11 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0354  prevent-host-death protein  38.1 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  35.82 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  56.1 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  55.26 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  55 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  44.9 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0479  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  52.63 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  52.78 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  43.66 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12845  hypothetical protein  55.56 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000444858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 76 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  53.85 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3077  prevent-host-death protein  40 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.128472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0707  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  46.3 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3752  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  51.28 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1901  prevent-host-death family protein  45.24 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00389172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>