168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1881 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1532 aa  2877    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.55 
 
 		 1081 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  46.15 
 
 		 1180 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  41.3 
 
 		 1111 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  39.88 
 
 		 1130 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  37.53 
 
 		 2407 aa  493  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  44.76 
 
 		 814 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  41.24 
 
 		 1019 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  42.27 
 
 		 987 aa  407  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  41.56 
 
 		 1881 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  38.75 
 
 		 1530 aa  377  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  37.63 
 
 		 1078 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  39.64 
 
 		 882 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  42.08 
 
 		 907 aa  359  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  33.03 
 
 		 1119 aa  330  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  36.84 
 
 		 1177 aa  270  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  31.33 
 
 		 2711 aa  263  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  30.93 
 
 		 1458 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  39.09 
 
 		 2578 aa  241  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  34.49 
 
 		 1971 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  39.64 
 
 		 2906 aa  230  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  36.69 
 
 		 3322 aa  224  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  29.98 
 
 		 1508 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.05 
 
 		 2003 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  33.09 
 
 		 3506 aa  212  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.94 
 
 		 1029 aa  210  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.84 
 
 		 3629 aa  211  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  29.97 
 
 		 1459 aa  210  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.11 
 
 		 1322 aa  208  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  31.51 
 
 		 1782 aa  195  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  38.81 
 
 		 678 aa  178  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  25.81 
 
 		 1519 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.77 
 
 		 1055 aa  166  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.35 
 
 		 1227 aa  166  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  30.43 
 
 		 3954 aa  166  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.47 
 
 		 2396 aa  164  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  31.07 
 
 		 1028 aa  163  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  30.76 
 
 		 2366 aa  160  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 4238 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  31.33 
 
 		 2365 aa  159  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  31.33 
 
 		 2346 aa  159  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.01 
 
 		 1285 aa  156  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  40.35 
 
 		 1861 aa  155  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  31.23 
 
 		 995 aa  155  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  31.38 
 
 		 995 aa  154  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  31.27 
 
 		 1882 aa  148  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  30.11 
 
 		 4238 aa  147  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  34.83 
 
 		 1113 aa  146  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  30.29 
 
 		 986 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.85 
 
 		 1011 aa  145  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  30.35 
 
 		 991 aa  145  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.97 
 
 		 1001 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  49.47 
 
 		 1038 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  49.38 
 
 		 983 aa  132  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.49 
 
 		 3391 aa  128  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  28.75 
 
 		 1001 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  42.78 
 
 		 1004 aa  127  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  29.6 
 
 		 2371 aa  125  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  45.51 
 
 		 1033 aa  125  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  31.69 
 
 		 816 aa  125  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  31.79 
 
 		 2057 aa  125  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.67 
 
 		 1333 aa  125  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.64 
 
 		 3089 aa  116  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  57.26 
 
 		 2926 aa  115  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  29.02 
 
 		 994 aa  113  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  39.27 
 
 		 1741 aa  112  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.63 
 
 		 919 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  24.95 
 
 		 990 aa  109  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 1571 aa  109  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.84 
 
 		 915 aa  108  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  40 
 
 		 1593 aa  106  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.43 
 
 		 1769 aa  103  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  37.95 
 
 		 861 aa  99.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.46 
 
 		 950 aa  99.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 		 1152 aa  99  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.03 
 
 		 972 aa  98.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25.3 
 
 		 1056 aa  98.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.29 
 
 		 1357 aa  97.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.69 
 
 		 1489 aa  97.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  36.28 
 
 		 2642 aa  97.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  28.24 
 
 		 650 aa  96.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  28.66 
 
 		 1006 aa  96.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.1 
 
 		 2363 aa  92  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 		 3420 aa  92  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 		 3415 aa  91.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1325 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.82 
 
 		 913 aa  90.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  44.71 
 
 		 1053 aa  90.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1446 aa  89  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  36.71 
 
 		 1108 aa  88.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.83 
 
 		 910 aa  87.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  29.67 
 
 		 965 aa  85.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  27.4 
 
 		 852 aa  81.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  23.26 
 
 		 4248 aa  79.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  35.06 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  30.54 
 
 		 3822 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 980 aa  78.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 1550 aa  77.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  29.42 
 
 		 1129 aa  77  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  29.42 
 
 		 1131 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>