154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1869 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  53.02 
 
 
823 aa  822    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  65.51 
 
 
796 aa  1082    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  61.17 
 
 
815 aa  1001    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  62.45 
 
 
811 aa  1009    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  47.48 
 
 
792 aa  758    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  66.58 
 
 
789 aa  1103    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  63.53 
 
 
810 aa  1029    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  57.93 
 
 
835 aa  945    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  57.27 
 
 
834 aa  948    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  43.52 
 
 
851 aa  646    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  67.65 
 
 
788 aa  1095    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  65.34 
 
 
792 aa  1041    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  55.77 
 
 
792 aa  871    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  68.25 
 
 
812 aa  1127    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  61.81 
 
 
1230 aa  969    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  64.62 
 
 
795 aa  1069    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  70.51 
 
 
793 aa  1175    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  63.92 
 
 
802 aa  1058    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  70.24 
 
 
804 aa  1158    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  70.62 
 
 
809 aa  1163    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  63.53 
 
 
796 aa  1010    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  67.85 
 
 
807 aa  1130    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  61.81 
 
 
1228 aa  967    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  69.9 
 
 
802 aa  1110    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  87.76 
 
 
784 aa  1387    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  86.48 
 
 
784 aa  1397    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  60.91 
 
 
802 aa  1029    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  64.45 
 
 
791 aa  1064    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  64.45 
 
 
791 aa  1064    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  62.23 
 
 
797 aa  1013    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  86.22 
 
 
784 aa  1389    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  66.28 
 
 
793 aa  1106    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  67.61 
 
 
802 aa  1105    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  67.52 
 
 
806 aa  1090    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  67.31 
 
 
800 aa  1094    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  60.18 
 
 
820 aa  980    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  56.25 
 
 
835 aa  918    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  49.42 
 
 
782 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  67.77 
 
 
800 aa  1102    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  64.39 
 
 
783 aa  1077    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  67.39 
 
 
794 aa  1115    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  71.13 
 
 
811 aa  1155    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  49.24 
 
 
794 aa  770    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  43.83 
 
 
817 aa  681    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  46.54 
 
 
818 aa  756    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  48.67 
 
 
788 aa  768    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  45.76 
 
 
813 aa  709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  60.83 
 
 
811 aa  989    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  60.66 
 
 
787 aa  1000    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  67.39 
 
 
797 aa  1078    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  68.12 
 
 
798 aa  1110    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  60.91 
 
 
802 aa  1027    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  67.52 
 
 
806 aa  1090    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  64.56 
 
 
832 aa  1027    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  60.36 
 
 
813 aa  996    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  76.65 
 
 
790 aa  1249    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  65.18 
 
 
833 aa  1061    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  61.17 
 
 
815 aa  1001    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  66.07 
 
 
789 aa  1066    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  67.39 
 
 
806 aa  1090    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  66.92 
 
 
792 aa  1060    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  65.16 
 
 
823 aa  1049    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  68.08 
 
 
800 aa  1102    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  66.45 
 
 
824 aa  1065    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  67.39 
 
 
811 aa  1093    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  59.54 
 
 
820 aa  962    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  67.86 
 
 
805 aa  1100    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  66.33 
 
 
792 aa  1099    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  68.36 
 
 
791 aa  1122    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  47.32 
 
 
803 aa  768    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  69.13 
 
 
790 aa  1133    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  65.35 
 
 
797 aa  1080    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  64.01 
 
 
821 aa  1051    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  68.72 
 
 
783 aa  1099    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  65 
 
 
795 aa  1086    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  61.94 
 
 
1305 aa  991    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  65.56 
 
 
832 aa  1066    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  63.79 
 
 
823 aa  1028    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  70.9 
 
 
797 aa  1152    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  68.88 
 
 
802 aa  1102    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  55.83 
 
 
811 aa  847    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  67.86 
 
 
800 aa  1087    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  66.79 
 
 
794 aa  1106    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  71.13 
 
 
811 aa  1154    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  67.26 
 
 
811 aa  1092    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  66.2 
 
 
851 aa  1053    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  66.16 
 
 
860 aa  1073    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  61.12 
 
 
820 aa  958    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  63.95 
 
 
832 aa  1026    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  66.07 
 
 
795 aa  1093    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  61.6 
 
 
794 aa  1003    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  62.61 
 
 
797 aa  1025    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  67.52 
 
 
811 aa  1093    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  69.34 
 
 
791 aa  1150    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  50.75 
 
 
825 aa  805    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  100 
 
 
783 aa  1617    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  49.04 
 
 
793 aa  804    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  68.66 
 
 
798 aa  1142    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  69.73 
 
 
795 aa  1172    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  61.94 
 
 
1230 aa  971    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>