279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1857 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  95.6 
 
 		 91 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  91.21 
 
 		 91 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  86.81 
 
 		 91 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  85.71 
 
 		 91 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  83.52 
 
 		 91 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  82.42 
 
 		 91 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  80.22 
 
 		 91 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  76.92 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  58.24 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  57.5 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  54.35 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  54.76 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  56.63 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  56.63 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  51.81 
 
 		 101 aa  84.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  53.09 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  53.09 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  50.62 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  50.62 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  55.56 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  51.19 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  53.16 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  51.81 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  51.19 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  46.67 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  53.16 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  50.6 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  53.09 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  52.38 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  52.38 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  52.38 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  54.12 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  47.67 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  54.32 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  47.13 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  52.56 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  58.33 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  51.72 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  44.83 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  52.56 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  52.56 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  52.56 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  58.06 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  53.16 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  48.68 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  51.28 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  45.98 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  45.98 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  52.56 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  52.56 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  50.65 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  52.56 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  55.22 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  51.14 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  55.22 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  59.32 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  55.13 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  51.95 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2536  protein of unknown function DUF156  47.89 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157002  normal  0.182354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  55.13 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  44.71 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  51.28 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  44.83 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  47.19 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  50.65 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  46.99 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  46.99 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  53.73 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  50.65 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1007  protein of unknown function DUF156  46.48 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  54.84 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  50.75 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0892  hypothetical protein  44.87 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.86741e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  43.68 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  62.26 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  62.26 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  36.05 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  40.7 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  48.1 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  45.88 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  40.48 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  40.48 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>