24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1765 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  58.36 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  57.27 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  54.92 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  50.21 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  49.61 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  40 
 
 		 567 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  39.24 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  34.44 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  37.5 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  30.28 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  37.17 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  35.2 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  39.24 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  30.81 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  29.82 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  38.71 
 
 		 208 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  39.02 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  40.68 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  40.68 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0056  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  36.84 
 
 		 180 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0254  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.09 
 
 		 180 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>