209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1643 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  82.53 
 
 		 269 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  76.95 
 
 		 270 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  75.46 
 
 		 270 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  75.84 
 
 		 270 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  78.44 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  74.31 
 
 		 275 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  70.98 
 
 		 268 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  72.94 
 
 		 270 aa  371  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.31 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  67.57 
 
 		 271 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  67.05 
 
 		 270 aa  348  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  68.63 
 
 		 265 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  68.63 
 
 		 265 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  68.46 
 
 		 265 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.2 
 
 		 266 aa  345  6e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  64.17 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  66.95 
 
 		 277 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  62.6 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  62.15 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  60.24 
 
 		 270 aa  311  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  60.31 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  62.8 
 
 		 270 aa  304  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  60.24 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  55.25 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  55.02 
 
 		 265 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  54.96 
 
 		 268 aa  295  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.33 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.34 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.1 
 
 		 267 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  56.1 
 
 		 267 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.42 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.42 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  61.04 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  58.3 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  58.3 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  58.3 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  54.88 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  56.8 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.88 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.15 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  55.25 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  57.32 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.73 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.69 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.86 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  57.48 
 
 		 273 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  56.1 
 
 		 268 aa  284  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  52.16 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  55.02 
 
 		 282 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  50.75 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  55.02 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  55.02 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  54.47 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.47 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  54.07 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.6 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  52.61 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  55.2 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  54.07 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  54.88 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  54.88 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  55.12 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  52.44 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  50.93 
 
 		 278 aa  278  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  54.88 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  55.24 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  55.69 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  53.97 
 
 		 285 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  54.89 
 
 		 272 aa  275  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  53.94 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  55.64 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  54.76 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  52.11 
 
 		 265 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  52.8 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  52.23 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  50.61 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  51.38 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  51.38 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  51.38 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.08 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.07 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  30.22 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  30.22 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.88 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  30.09 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.63 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.36 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  29.69 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  33.04 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  30.86 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  32.13 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  25 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.67 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  31.4 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.4 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.11 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.11 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  27.11 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  27.11 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>