101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1415 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  100 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  55.15 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  50.46 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  45.63 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  36.92 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  37.65 
 
 		 512 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  34.65 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  37.25 
 
 		 512 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.96 
 
 		 513 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  36.84 
 
 		 510 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  36.43 
 
 		 494 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  32.5 
 
 		 505 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  32.94 
 
 		 508 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  34.07 
 
 		 508 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  34.07 
 
 		 508 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.51 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  33.92 
 
 		 511 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  31.71 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  35.27 
 
 		 490 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  31.44 
 
 		 543 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  33.84 
 
 		 510 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  32.09 
 
 		 495 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.25 
 
 		 596 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  32.1 
 
 		 514 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.87 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  30.28 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  30.42 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  30.32 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.46 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.38 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  31.63 
 
 		 543 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  28.34 
 
 		 519 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  34.13 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  30.67 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  32.42 
 
 		 545 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  27.24 
 
 		 920 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  33.2 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  41 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.73 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  27.13 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  29.55 
 
 		 492 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  30.22 
 
 		 496 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  32.23 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  25.45 
 
 		 539 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  28.21 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  27.17 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.49 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  29.12 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.12 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  30.98 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  27.3 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  29.46 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  28.92 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 		 640 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  28.92 
 
 		 640 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 		 640 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  26.64 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.6 
 
 		 523 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  28.92 
 
 		 691 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  28.92 
 
 		 649 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  28.51 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.15 
 
 		 505 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  28.4 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  27.42 
 
 		 721 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.44 
 
 		 445 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  28.31 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.17 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  28.8 
 
 		 643 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.44 
 
 		 498 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.57 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  26.95 
 
 		 544 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.18 
 
 		 527 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.94 
 
 		 524 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  26.64 
 
 		 505 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  25.6 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.39 
 
 		 521 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  25.21 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  25.58 
 
 		 509 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  25 
 
 		 344 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  20.95 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  23.92 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  29.69 
 
 		 518 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  27.59 
 
 		 534 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  27.81 
 
 		 540 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  30.23 
 
 		 523 aa  46.2  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.02 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  24.88 
 
 		 719 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  28.87 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  22.33 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28.16 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  28.23 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  24.61 
 
 		 523 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.47 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  28.29 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  21.97 
 
 		 522 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  24.09 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>