More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1407 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  93.09 
 
 		 553 aa  1017    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  83.73 
 
 		 552 aa  913    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.87 
 
 		 548 aa  917    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  91.56 
 
 		 557 aa  979    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  100 
 
 		 550 aa  1099    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  62.66 
 
 		 552 aa  670    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  62.55 
 
 		 556 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  61.54 
 
 		 550 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  58.8 
 
 		 541 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  56.29 
 
 		 532 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  62.4 
 
 		 549 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  55.08 
 
 		 545 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  55.43 
 
 		 556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  59.65 
 
 		 534 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  54.38 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  55.32 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  54.55 
 
 		 539 aa  558  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  55.74 
 
 		 585 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  55.7 
 
 		 552 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  55.72 
 
 		 540 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  57.25 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  56.22 
 
 		 546 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  57.58 
 
 		 534 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  55.84 
 
 		 545 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  54.51 
 
 		 547 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  54.6 
 
 		 534 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  56.87 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  53.17 
 
 		 558 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  54 
 
 		 549 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  53.37 
 
 		 538 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56.16 
 
 		 540 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  53.45 
 
 		 552 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  52.75 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  56.9 
 
 		 560 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  52.18 
 
 		 552 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  50.75 
 
 		 546 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  53.06 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  49.72 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  49.19 
 
 		 612 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  48.96 
 
 		 531 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.25 
 
 		 555 aa  475  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.86 
 
 		 615 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.74 
 
 		 611 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  47.83 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.51 
 
 		 617 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.37 
 
 		 619 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  46.89 
 
 		 593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  47.91 
 
 		 571 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.99 
 
 		 545 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  46.5 
 
 		 555 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  49.16 
 
 		 537 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  49.27 
 
 		 586 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  47.92 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  47.84 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  46.81 
 
 		 609 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  47.83 
 
 		 541 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  45.86 
 
 		 610 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  48.1 
 
 		 625 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  49.28 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  48.12 
 
 		 562 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 		 568 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  46.45 
 
 		 606 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  47.4 
 
 		 623 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  47.48 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  46.07 
 
 		 555 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.77 
 
 		 625 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  47.49 
 
 		 640 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 		 625 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  49.63 
 
 		 539 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  46 
 
 		 547 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  47.15 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  44.17 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  47.22 
 
 		 623 aa  458  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 601 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.81 
 
 		 586 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  47.83 
 
 		 543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  46.72 
 
 		 542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 		 627 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 		 536 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  46.9 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.58 
 
 		 626 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 		 629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.43 
 
 		 545 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.96 
 
 		 575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  49.53 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  46.34 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  46.82 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.31 
 
 		 610 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.24 
 
 		 525 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  48.31 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  47.31 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  47.31 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  47.31 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  47.31 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.79 
 
 		 630 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  46.59 
 
 		 624 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.96 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.8 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.37 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>