More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1386 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  91.48 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  90.58 
 
 		 224 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  83.86 
 
 		 246 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  77.58 
 
 		 224 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  52.91 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  48.48 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  48.26 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  46.09 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  46.09 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  45.65 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  45.65 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  47.6 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  42.86 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  43.48 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  42.61 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  44.35 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  43.04 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  43.91 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  43.91 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  44.1 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  41.74 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  39.04 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  39.3 
 
 		 241 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  38.43 
 
 		 295 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  35.81 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  39.44 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  37.55 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  37.12 
 
 		 295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  37.12 
 
 		 295 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  36.61 
 
 		 292 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  36.89 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  36.68 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  38.32 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  33.9 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  34.51 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  35.4 
 
 		 295 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.31 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  32.03 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  35.41 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  34.35 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  34.62 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  36.5 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  31.7 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  35.22 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  35.53 
 
 		 296 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 		 296 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  30.36 
 
 		 407 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  31.44 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  34.67 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  35.68 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  29.82 
 
 		 407 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  36.96 
 
 		 305 aa  99.4  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  28.89 
 
 		 292 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  35.29 
 
 		 305 aa  98.6  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  31.49 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  31.76 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  30.87 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2579  Carboxymethylenebutenolidase  32.14 
 
 		 273 aa  96.3  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  35.5 
 
 		 295 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  32.22 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  30.26 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3286  dienelactone hydrolase  35.45 
 
 		 320 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.82 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  32.29 
 
 		 410 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  30.38 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1006  dienelactone hydrolase family protein  35.92 
 
 		 320 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  34.68 
 
 		 331 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0833  twin-arginine translocation pathway signal  33.6 
 
 		 320 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.704656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  32.68 
 
 		 295 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 		 433 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  30.04 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.56 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  32.28 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  30.7 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  29.39 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  29.24 
 
 		 263 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  31.02 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 		 271 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  31.02 
 
 		 271 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  31.02 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  31.02 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  30.08 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  36.05 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  31.02 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>