177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1318 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  100 
 
 
249 aa  492  1e-138  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  88.28 
 
 
245 aa  438  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  87.45 
 
 
246 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  80.74 
 
 
246 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  46.19 
 
 
236 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2155  AzlC family protein  40.44 
 
 
237 aa  145  4e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.766728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  39.18 
 
 
235 aa  140  2e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  34.93 
 
 
246 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  34.22 
 
 
236 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  32.79 
 
 
245 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  35.65 
 
 
256 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  34.93 
 
 
246 aa  121  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  34.31 
 
 
246 aa  120  2e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  35.29 
 
 
265 aa  117  1e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  34.68 
 
 
244 aa  117  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  34.88 
 
 
313 aa  117  1e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  34.68 
 
 
244 aa  117  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  34.68 
 
 
244 aa  117  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  34.12 
 
 
242 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  34.12 
 
 
242 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  34.12 
 
 
242 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  32.08 
 
 
237 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  34.68 
 
 
244 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  34.26 
 
 
244 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  34.23 
 
 
245 aa  115  7e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  32.29 
 
 
242 aa  114  2e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  32.03 
 
 
239 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  34.23 
 
 
245 aa  113  4e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  35.07 
 
 
243 aa  110  2e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  31.2 
 
 
236 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.65167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  34.48 
 
 
239 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  35.71 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  29.85 
 
 
248 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  28.85 
 
 
243 aa  84.7  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  28.77 
 
 
233 aa  85.1  1e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  28.85 
 
 
243 aa  84.7  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  24.28 
 
 
243 aa  80.5  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.82 
 
 
229 aa  80.1  3e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  30.53 
 
 
226 aa  78.2  1e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  27.31 
 
 
231 aa  77.8  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  27.31 
 
 
231 aa  77.8  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.97 
 
 
241 aa  76.3  4e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.54 
 
 
241 aa  76.3  4e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  27.16 
 
 
242 aa  76.3  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.97 
 
 
241 aa  75.9  5e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.97 
 
 
241 aa  75.9  5e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.97 
 
 
241 aa  76.3  5e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.97 
 
 
241 aa  75.9  5e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  27.97 
 
 
241 aa  75.9  6e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  26.64 
 
 
240 aa  75.9  6e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  30.64 
 
 
258 aa  75.5  7e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.54 
 
 
241 aa  75.5  7e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  26.29 
 
 
242 aa  75.5  8e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  27.54 
 
 
238 aa  74.7  1e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  27.54 
 
 
241 aa  75.1  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  30.81 
 
 
257 aa  75.1  1e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  30.53 
 
 
246 aa  75.1  1e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  26.27 
 
 
244 aa  73.9  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  26.67 
 
 
240 aa  73.6  3e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  73.6  3e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  32.97 
 
 
242 aa  73.2  4e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.23 
 
 
233 aa  72.4  7e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  27.93 
 
 
241 aa  71.6  1e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  28.65 
 
 
228 aa  71.2  1e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  31.82 
 
 
265 aa  71.2  1e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  27.94 
 
 
240 aa  70.9  2e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  32.97 
 
 
242 aa  70.9  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  30.96 
 
 
231 aa  70.9  2e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  28.5 
 
 
253 aa  69.7  4e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  25.35 
 
 
242 aa  69.7  5e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  26.52 
 
 
230 aa  68.9  7e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  28.49 
 
 
240 aa  68.6  9e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  28.45 
 
 
235 aa  67  2e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  30.41 
 
 
258 aa  67.8  2e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  27.14 
 
 
239 aa  66.6  3e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  29.03 
 
 
238 aa  66.6  4e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  29.07 
 
 
234 aa  65.9  6e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  30.36 
 
 
253 aa  65.1  1e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  27.36 
 
 
230 aa  63.2  4e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  27.75 
 
 
255 aa  63.2  4e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  28.44 
 
 
239 aa  63.2  4e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  28.95 
 
 
234 aa  62.4  6e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  30.21 
 
 
238 aa  62.4  7e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  26.83 
 
 
227 aa  62.4  7e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.18958e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  26.98 
 
 
244 aa  62  9e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  28.22 
 
 
252 aa  61.6  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  29.46 
 
 
255 aa  61.6  1e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.12 
 
 
242 aa  61.6  1e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  27.46 
 
 
286 aa  61.6  1e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  29.14 
 
 
249 aa  61.6  1e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  28.94 
 
 
273 aa  61.2  2e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  29.02 
 
 
255 aa  60.1  3e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0849  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  25.57 
 
 
242 aa  60.5  3e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  9.03381e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  27.35 
 
 
285 aa  59.7  4e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.35 
 
 
273 aa  59.7  4e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  30 
 
 
257 aa  59.3  5e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.53015e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  25 
 
 
246 aa  59.7  5e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  30 
 
 
257 aa  59.3  6e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27.2 
 
 
273 aa  59.3  6e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>