25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1272 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  100 
 
 		 444 aa  843    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  45.49 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  44.72 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  29.75 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  29.75 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  29.75 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  29 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  28.54 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  29.84 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  25.99 
 
 		 496 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  26.68 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  26.79 
 
 		 552 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  30.55 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  31.79 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  27.09 
 
 		 498 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  28.54 
 
 		 627 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  31.13 
 
 		 481 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  28.84 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  28.87 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  27.88 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  25.25 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  27.09 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  27.74 
 
 		 392 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3330  curlin associated  31.58 
 
 		 151 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  34.91 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>