More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1216 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  100 
 
 		 420 aa  821    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  73.4 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  74.82 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  68.47 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.99 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.75 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  30.49 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  31.88 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  25.06 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  32.11 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.93 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.87 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.06 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.95 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.42 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  27.58 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  23.66 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.28 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.18 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  25.55 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  26.47 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  28.31 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  28.61 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  28.19 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  29.34 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  27.56 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  25.75 
 
 		 443 aa  86.3  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  25 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  29.17 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.67 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.91 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.9 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  24.51 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  27.38 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  29.16 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.33 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.62 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  26.08 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  25.56 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.64 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.95 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.9 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.68 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  24.17 
 
 		 481 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  26.43 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  22.73 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.23 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.81 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.5 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.57 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.75 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  27.54 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.63 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  31.1 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  24.42 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.18 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.05 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.51 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.65 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.54 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.5 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  24.1 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  20.16 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7472  ferredoxin  26.09 
 
 		 292 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.554725 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  32.89 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  26.86 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  30.96 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0405  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.74 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.96 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  30.28 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0230  globin  22.49 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.72 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0224  globin  22.49 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  24.9 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  25.42 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  24.42 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  25.08 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  26.83 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.97 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  25.08 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.85 
 
 		 341 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.73 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.15 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.1 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.14 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  24.75 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  26.5 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  27.45 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  27.45 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  27.8 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  27.45 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0337  ferredoxin  28.57 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2361  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.46 
 
 		 514 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000108659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  34.31 
 
 		 337 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>