More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1074 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  59.34 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  59.34 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  57.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  57.14 
 
 		 274 aa  314  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  58.09 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  53.51 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  53.51 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  52.52 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  49.08 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  49.08 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  50 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  48.71 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  48.71 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  53.22 
 
 		 235 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  47.97 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  47.97 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  46.09 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  44.36 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  42.7 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  45.97 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  42.48 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  42.48 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  42.48 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  42.48 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  42.48 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  42.48 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  44.66 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  42.48 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  42.48 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  43.46 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  43.23 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  47.79 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  44.19 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  43.85 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  41.45 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  41.85 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  43.94 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  43.94 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  43.94 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  43.68 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  42.05 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 274 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  42.64 
 
 		 274 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  48.02 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  44.19 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  42.69 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  42.31 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  39.76 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  47.15 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  41.92 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  44.02 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  38.28 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  38.28 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  38.28 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  38.28 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  38.28 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4299  transposase  64.71 
 
 		 197 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>