More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0927 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  100 
 
 		 290 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  90.34 
 
 		 290 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  90.34 
 
 		 290 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  84.08 
 
 		 291 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  83.74 
 
 		 289 aa  460  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  84.43 
 
 		 289 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  80.34 
 
 		 290 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  66.9 
 
 		 290 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  63.51 
 
 		 291 aa  332  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  65.73 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  65.73 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  65.73 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 289 aa  318  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  67.18 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  59.38 
 
 		 289 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  63.73 
 
 		 288 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  57.14 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  60.14 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  59.03 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  57.65 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  59.3 
 
 		 288 aa  302  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  58.01 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  57.89 
 
 		 291 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  63.03 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  60.34 
 
 		 290 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  58.89 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  60 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  56.23 
 
 		 284 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  58.68 
 
 		 288 aa  289  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  58.28 
 
 		 290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  54.96 
 
 		 284 aa  288  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  55.52 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  59.17 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  59.14 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  52.7 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  52.98 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  56.73 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  52.67 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  52.3 
 
 		 287 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  47.52 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  57.64 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.95 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.41 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.6 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.5 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.72 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  30.82 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.16 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  36.27 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  36.27 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.95 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  29.67 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.52 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  27.95 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  32.26 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  27.17 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  32.26 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.73 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.73 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  30.39 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.67 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.56 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  29.58 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  24.83 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.47 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.7 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.7 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.7 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  31.16 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.59 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  27.99 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.59 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  28.83 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.58 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  25.35 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 351 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.08 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  30.15 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  30.63 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  29.8 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  28.26 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  29.25 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  29.25 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  27.04 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  27.24 
 
 		 415 aa  98.2  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  30.22 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>