More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0923 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 354 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  82.91 
 
 		 354 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  82.91 
 
 		 354 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  72.6 
 
 		 354 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  68.39 
 
 		 352 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  41.23 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  42.57 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  41.62 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  41.14 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  42.57 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  42.27 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  42.61 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  42.61 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  42.61 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  42.61 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.61 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  42.57 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  42.03 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  41.16 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  40.75 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  41.45 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.46 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  41.98 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  40.17 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  39 
 
 		 365 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  40.57 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  42.02 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  40.06 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  40.06 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  37.21 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  41.38 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  37.68 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  38.51 
 
 		 400 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  42.86 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  35.36 
 
 		 394 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  39.76 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  37.94 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 		 349 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  39.03 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  38.18 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  36.08 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  37.17 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 		 363 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  36.56 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  37.11 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  34.76 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  36.04 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  35.49 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.19 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  36.66 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  31.91 
 
 		 353 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  30.72 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  29.41 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  28.16 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 327 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24.01 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  25.55 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  26.44 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  24.92 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.35 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  24.13 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.67 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>