299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0907 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  81.74 
 
 		 471 aa  799    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  100 
 
 		 472 aa  965    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  78.6 
 
 		 472 aa  772    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  91.74 
 
 		 472 aa  904    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  83.05 
 
 		 476 aa  826    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  92.37 
 
 		 472 aa  909    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  81.57 
 
 		 472 aa  803    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  63.85 
 
 		 465 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  63.03 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  61.04 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  60.61 
 
 		 463 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  60.39 
 
 		 463 aa  581  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  60.31 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  60.31 
 
 		 465 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  59.43 
 
 		 474 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  61.41 
 
 		 471 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  61.19 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  59.02 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  58.23 
 
 		 467 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  59.36 
 
 		 471 aa  549  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  60.26 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  58.8 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  59.01 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  58.58 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  60.69 
 
 		 435 aa  521  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  57.17 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  57.17 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  56.07 
 
 		 461 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  53.52 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  52.98 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  53.61 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  54.92 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  53.95 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  51.2 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  51.97 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  51.97 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  50.33 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  50.11 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  50.98 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  50.77 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  50.11 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  50.98 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  50.55 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  49.89 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  50 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  52.97 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  49.68 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  49.13 
 
 		 465 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  51.31 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  49.44 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  50.22 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  50.66 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  48.99 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  44.08 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  48.51 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  47.6 
 
 		 459 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  51.02 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  44.76 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  43.63 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  43.6 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  43.89 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  44.88 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  44.98 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  44.22 
 
 		 460 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  41.74 
 
 		 476 aa  348  9e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  41.74 
 
 		 476 aa  348  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  42.2 
 
 		 481 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  42.34 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  41.39 
 
 		 511 aa  342  9e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  43.23 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  40.94 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  41.2 
 
 		 472 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  40.82 
 
 		 504 aa  330  3e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  41.33 
 
 		 471 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  40.99 
 
 		 470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  40.85 
 
 		 475 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  40.17 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  40.36 
 
 		 516 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  39.19 
 
 		 475 aa  320  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  39.19 
 
 		 475 aa  320  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  40.71 
 
 		 547 aa  318  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  39.28 
 
 		 475 aa  318  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  40.26 
 
 		 483 aa  316  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  39.42 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  38.48 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  38.72 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  38.66 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  39.25 
 
 		 473 aa  311  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  38.62 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  40.13 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  41.76 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  39.36 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  38.6 
 
 		 473 aa  309  8e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  39.91 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  38.54 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  39.91 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  38.78 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  39.91 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  39.91 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  39.91 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>