16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0658 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  42.86 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  48.48 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  42.01 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  36.57 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  31.51 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  35.07 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  30.6 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  30.43 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  30.43 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  34.09 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  32.28 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  27.03 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  26.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  29.84 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  35.19 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>