140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0631 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  87.07 
 
 
233 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  85.22 
 
 
236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  83.26 
 
 
237 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  81.94 
 
 
235 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  80.89 
 
 
238 aa  377  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  77.63 
 
 
231 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  59.73 
 
 
249 aa  284  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.95 
 
 
243 aa  244  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.56 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.88 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.46 
 
 
243 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  51.33 
 
 
234 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.95 
 
 
268 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  53.1 
 
 
250 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  50.88 
 
 
234 aa  235  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.5 
 
 
243 aa  234  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.22 
 
 
237 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.58 
 
 
232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.71 
 
 
248 aa  232  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.71 
 
 
248 aa  232  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.36 
 
 
249 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.13 
 
 
237 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.42 
 
 
240 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.45 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  47.96 
 
 
238 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  43.05 
 
 
215 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.95 
 
 
280 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  43.12 
 
 
213 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.91 
 
 
240 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  40.18 
 
 
214 aa  168  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.41 
 
 
215 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.06 
 
 
222 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  39.53 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.41 
 
 
228 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.81 
 
 
215 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  40.81 
 
 
215 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  41.71 
 
 
237 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  41.76 
 
 
220 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.46 
 
 
221 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.52 
 
 
220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.25 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  34.05 
 
 
287 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.2 
 
 
217 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 
281 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  33 
 
 
285 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.33 
 
 
233 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  35.14 
 
 
322 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30.39 
 
 
212 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  31.15 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.53 
 
 
214 aa  95.9  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  28.02 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  32.93 
 
 
334 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  32.8 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.43 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  29.51 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  31.35 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.27 
 
 
267 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  30.27 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.81 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.88 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.88 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  29.73 
 
 
267 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  31.29 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.38 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  25.35 
 
 
287 aa  62.4  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  25.7 
 
 
188 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.69 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.57 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  36.13 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.96 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.91 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  25.96 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0682  HAD hydrolase, family IA, variant 3  30.65 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  19.76 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  25.91 
 
 
212 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  35.85 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.85 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  25.3 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
228 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  25 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0457  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase cbbY-like protein  27.88 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0760422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  26.02 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.04 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.38 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  25.7 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  25.7 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  26.87 
 
 
965 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  25.7 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>