222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0599 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  83.27 
 
 
277 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  84.19 
 
 
277 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  75.56 
 
 
279 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  72.99 
 
 
312 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  72.32 
 
 
289 aa  349  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  70.96 
 
 
281 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  62.5 
 
 
296 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  63.6 
 
 
311 aa  293  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  56.84 
 
 
295 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  56.14 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  60.7 
 
 
297 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  60.7 
 
 
297 aa  278  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  53.1 
 
 
298 aa  275  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  59.36 
 
 
296 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  52.94 
 
 
297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  52.94 
 
 
297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  51.59 
 
 
298 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  51.89 
 
 
320 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  51.56 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  49.82 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  52.13 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  51.05 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  48.41 
 
 
294 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  50.53 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  49.62 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  55.17 
 
 
299 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  43.25 
 
 
296 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  50.41 
 
 
293 aa  211  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  46.1 
 
 
279 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  48.52 
 
 
289 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  48.16 
 
 
279 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  51.48 
 
 
270 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  51.11 
 
 
270 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  45.22 
 
 
308 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  48.55 
 
 
272 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  42.75 
 
 
305 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  48.96 
 
 
289 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  47.67 
 
 
274 aa  165  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.588911 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  42.27 
 
 
376 aa  162  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  40.62 
 
 
330 aa  158  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  39.56 
 
 
348 aa  138  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
257 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  39.47 
 
 
354 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  39.52 
 
 
264 aa  130  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  39.39 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  39.85 
 
 
260 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  36.59 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  37.77 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  38.74 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  39.88 
 
 
295 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  31.64 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  31.64 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  37.84 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  28.14 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  36.1 
 
 
294 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  39.53 
 
 
291 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  32.1 
 
 
291 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  35.9 
 
 
295 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  32.07 
 
 
309 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  34.41 
 
 
307 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  35.15 
 
 
240 aa  100  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  38.95 
 
 
306 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  39.18 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  31.41 
 
 
281 aa  99  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  31.41 
 
 
281 aa  99  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
319 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.25 
 
 
333 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.93 
 
 
558 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  31.44 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  31.6 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  31.6 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  31.6 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  30.42 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  29.48 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.04 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  30.07 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  28.79 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.73 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  29.52 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  31.65 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  32.56 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.88 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  29.3 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  29.5 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.05 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  26.26 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  29.17 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>