113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0565 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  76.67 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  70.88 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  74.66 
 
 		 373 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  60.49 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  60 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  40.29 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  39.13 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  32.6 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  34.36 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  34.23 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  33.14 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  27.17 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  26.76 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  32.86 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  31.08 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.68 
 
 		 679 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  30.29 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.29 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1551  fusaric acid resistance domain protein  30.29 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.71 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  29.71 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1802  fusaric acid resistance protein region  28.8 
 
 		 677 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  32.82 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.04 
 
 		 653 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.73 
 
 		 677 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  34.1 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  30.61 
 
 		 653 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3993  hypothetical protein  26.61 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0182739  normal  0.26526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  27.94 
 
 		 712 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  27.94 
 
 		 712 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.25 
 
 		 722 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  36.42 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0430  membrane protein  29.1 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0785433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  27.45 
 
 		 712 aa  50.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  31.01 
 
 		 790 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  33.99 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  32.86 
 
 		 217 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  32.86 
 
 		 217 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  26.12 
 
 		 770 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  30.53 
 
 		 659 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  28.16 
 
 		 670 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  36.8 
 
 		 203 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  36.8 
 
 		 203 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24 
 
 		 720 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  26.49 
 
 		 184 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  38.81 
 
 		 724 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  32.46 
 
 		 676 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  26.47 
 
 		 721 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2848  hypothetical protein  25.81 
 
 		 193 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2051  Fusaric acid resistance protein conserved region  31.3 
 
 		 752 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  26.96 
 
 		 731 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  33.16 
 
 		 673 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  33.16 
 
 		 673 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  25.39 
 
 		 720 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  33.16 
 
 		 673 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1783  hypothetical protein  29.45 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  32.34 
 
 		 728 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  28.93 
 
 		 682 aa  46.2  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  25 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  32.34 
 
 		 729 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  25.56 
 
 		 730 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  44.29 
 
 		 635 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  33.13 
 
 		 676 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  31.51 
 
 		 724 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  24 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  24.5 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5298  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.89 
 
 		 678 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.812245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  25 
 
 		 717 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01615  conserved inner membrane protein  29.47 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1995  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.89 
 
 		 670 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000064393  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2534  hypothetical protein  34.92 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  30.94 
 
 		 679 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.72 
 
 		 727 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  29.5 
 
 		 679 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1722  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.89 
 
 		 670 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1856  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.47 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0794628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  26.96 
 
 		 711 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.31 
 
 		 746 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1984  fusaric acid resistance protein region  29.89 
 
 		 670 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0152424  hitchhiker  0.000622676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1553  fusaric acid resistance domain-containing protein  29.89 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.266646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  33.13 
 
 		 676 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  25.62 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1837  fusaric acid resistance domain protein  29.47 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2357  fusaric acid resistance domain protein  29.89 
 
 		 663 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000905484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.72 
 
 		 727 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.74 
 
 		 724 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.67 
 
 		 704 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4756  fusaric acid resistance protein region  37.5 
 
 		 678 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  34.01 
 
 		 188 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2546  hypothetical protein  29.03 
 
 		 711 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00487152  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  37.5 
 
 		 678 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  27.91 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  34.01 
 
 		 188 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>