More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0561 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  92.13 
 
 		 305 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  91.15 
 
 		 305 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  85.25 
 
 		 305 aa  543  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  84.92 
 
 		 306 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  81.31 
 
 		 306 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  82.95 
 
 		 305 aa  530  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  68.2 
 
 		 305 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  60.33 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  59.34 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  59.34 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  59.34 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  55.37 
 
 		 307 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  54.9 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  54.72 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  54.02 
 
 		 310 aa  332  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  54.58 
 
 		 306 aa  332  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  51.76 
 
 		 313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  54.25 
 
 		 307 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  55.99 
 
 		 294 aa  326  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  51.6 
 
 		 311 aa  324  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  53.38 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  54.36 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  50.8 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  53.09 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  51.6 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  50.32 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  53.66 
 
 		 307 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  54.01 
 
 		 307 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  52.6 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  52 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 		 293 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  53.5 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  52.43 
 
 		 298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  51.9 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  52.94 
 
 		 291 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  52.92 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  50.87 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  52.78 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  54.17 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  52.45 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  52.08 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  51.71 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  52.45 
 
 		 289 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  52.1 
 
 		 293 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  50.52 
 
 		 291 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  51.75 
 
 		 293 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.76 
 
 		 296 aa  292  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  51 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  51.41 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  51.22 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  49.68 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  51.57 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  52.6 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 		 293 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 		 293 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  51.05 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  49.83 
 
 		 287 aa  281  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  49.66 
 
 		 307 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  49.15 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  50.9 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  50.9 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  48.4 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  48.04 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  50 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  48.39 
 
 		 294 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  48.39 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  47.67 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  45.64 
 
 		 290 aa  266  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  49.31 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  48.03 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  48.03 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  51.2 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  49.52 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  48.62 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  48.79 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  47.92 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  49.08 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  41.7 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  42.71 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  42.36 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  48.95 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  42.66 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  41.9 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  41.7 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  41.7 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  40.07 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  46.67 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  40.22 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  40.71 
 
 		 381 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  37.55 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  36.94 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  35.61 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  38.15 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  37.23 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>