More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0532 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  84.65 
 
 		 392 aa  696    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  91.84 
 
 		 392 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 		 392 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  91.33 
 
 		 392 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  79.59 
 
 		 392 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  92.35 
 
 		 392 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 392 aa  792    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  77.32 
 
 		 390 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  77.32 
 
 		 398 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  75.9 
 
 		 394 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  75.38 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  75.38 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  74.87 
 
 		 394 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  75.9 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  73.86 
 
 		 394 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  76.8 
 
 		 393 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  76.8 
 
 		 393 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  75.58 
 
 		 408 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  73.35 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  75.19 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  75.26 
 
 		 391 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  72.87 
 
 		 393 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  74.29 
 
 		 391 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  74.6 
 
 		 393 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  74.23 
 
 		 391 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  72.68 
 
 		 390 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  74.03 
 
 		 393 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  74.87 
 
 		 391 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  73.1 
 
 		 394 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  72.89 
 
 		 391 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  72.75 
 
 		 391 aa  588  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  73.45 
 
 		 390 aa  584  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  71.98 
 
 		 390 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  71.65 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  71.91 
 
 		 391 aa  578  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  69.74 
 
 		 393 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  71.24 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  70.62 
 
 		 390 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  70.36 
 
 		 390 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0632  acetyl-CoA acetyltransferase  69.07 
 
 		 390 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  66.92 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  66.24 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  66.15 
 
 		 393 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 		 393 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  64.95 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  66.15 
 
 		 393 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  68.03 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  65.64 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  65.64 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  65.13 
 
 		 393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  65.13 
 
 		 393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  64.96 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  63.94 
 
 		 393 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1469  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  63.68 
 
 		 393 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  65.64 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  65.64 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  65.73 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  63.33 
 
 		 392 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  62.72 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  63.08 
 
 		 392 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 		 392 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  63.33 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  64.12 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  61.79 
 
 		 392 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  63.17 
 
 		 392 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  63.08 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  65.47 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  62.15 
 
 		 392 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  62.92 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  61.89 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  61.64 
 
 		 393 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  62.15 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  62.4 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  64.96 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  61.64 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  62.37 
 
 		 393 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  60.98 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 		 392 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  59.74 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>