More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0460 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0582  integral membrane protein MviN  82.4 
 
 		 518 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0591354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0250  integral membrane protein MviN  82.01 
 
 		 518 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0714023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0460  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 518 aa  962    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.980377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  59.88 
 
 		 518 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0458  integral membrane protein MviN  66.02 
 
 		 537 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0011  integral membrane protein MviN  61.28 
 
 		 529 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0217  virulence factor MVIN-like  59.38 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  38.3 
 
 		 512 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  36.95 
 
 		 529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  35.79 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  36.95 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  36.82 
 
 		 529 aa  243  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 		 514 aa  239  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  37.43 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  36.35 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  34.84 
 
 		 528 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  35.03 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 		 543 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  37.89 
 
 		 528 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  35.63 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  36.83 
 
 		 514 aa  229  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  35.31 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  36.76 
 
 		 534 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  37.07 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  34.56 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  34.72 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  36.57 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  37.33 
 
 		 508 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  37.07 
 
 		 509 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  35.32 
 
 		 513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  35.59 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  35.38 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 		 509 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  37.6 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  35.96 
 
 		 532 aa  210  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  34.68 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  35.14 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  34.49 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  32.93 
 
 		 528 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  32.14 
 
 		 512 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  35.16 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  33.07 
 
 		 512 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  36.63 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  38.31 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  34.66 
 
 		 515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 		 522 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  34.19 
 
 		 511 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 		 511 aa  200  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  31.5 
 
 		 508 aa  200  6e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  27.51 
 
 		 495 aa  199  7e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  35.13 
 
 		 515 aa  199  7e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  32.56 
 
 		 511 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.28 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  33.53 
 
 		 528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  40.43 
 
 		 510 aa  198  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  31.77 
 
 		 511 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 511 aa  196  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  34.98 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  34.66 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  36.61 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  35.95 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  32.48 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  35.02 
 
 		 525 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  35.02 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  32.44 
 
 		 516 aa  193  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 		 513 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.14 
 
 		 529 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  32.67 
 
 		 530 aa  190  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  35.28 
 
 		 509 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  34.68 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.03 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  32.72 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.25 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  30.69 
 
 		 518 aa  186  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  31.14 
 
 		 520 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  30.23 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  29.55 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  31.36 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  34.24 
 
 		 521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  32.04 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  39.43 
 
 		 527 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.14 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.15 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  33.19 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  34.4 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  34.4 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  33.1 
 
 		 512 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  35.27 
 
 		 521 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  33.93 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  31.8 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  31.8 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>