More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0378 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  100 
 
 
327 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  84.71 
 
 
341 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  76.76 
 
 
327 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  73.7 
 
 
329 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  72.56 
 
 
329 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  72.26 
 
 
328 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  73.09 
 
 
327 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  71.56 
 
 
327 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.89 
 
 
327 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.89 
 
 
327 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  66.67 
 
 
327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.44 
 
 
328 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  66.06 
 
 
327 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  66.56 
 
 
336 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.42 
 
 
347 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  65.14 
 
 
334 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.03 
 
 
329 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  65.24 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.63 
 
 
338 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.11 
 
 
328 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  66.36 
 
 
326 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.22 
 
 
327 aa  407  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.15 
 
 
328 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  62.5 
 
 
333 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.77 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  59.51 
 
 
328 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.35 
 
 
328 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.55 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.62 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.62 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.2 
 
 
328 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.53 
 
 
326 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.04 
 
 
332 aa  391  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  61.54 
 
 
334 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.3 
 
 
327 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.31 
 
 
327 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60 
 
 
329 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.58 
 
 
330 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  56.13 
 
 
328 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  56.13 
 
 
328 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.68 
 
 
324 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.52 
 
 
345 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.27 
 
 
328 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.39 
 
 
327 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.59 
 
 
335 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.59 
 
 
335 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.69 
 
 
327 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  61.96 
 
 
328 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
329 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.66 
 
 
328 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.08 
 
 
329 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.66 
 
 
328 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  61.47 
 
 
328 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.66 
 
 
328 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  61.66 
 
 
328 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.66 
 
 
328 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.77 
 
 
331 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.39 
 
 
331 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  57.45 
 
 
334 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  55.62 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.54 
 
 
331 aa  347  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  57.24 
 
 
304 aa  335  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.7 
 
 
332 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  47.76 
 
 
332 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 
333 aa  292  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.95 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.84 
 
 
323 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.05 
 
 
334 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  49.36 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  49.55 
 
 
332 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
332 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  49.51 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.41 
 
 
380 aa  270  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  49.35 
 
 
333 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.2 
 
 
332 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.42 
 
 
332 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  47.2 
 
 
346 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 
338 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.41 
 
 
338 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  46.41 
 
 
338 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  43.87 
 
 
358 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  38.48 
 
 
344 aa  255  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.21 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0181  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase (ADH-HT). oxidoreductase protein  60.22 
 
 
188 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.06 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.6 
 
 
338 aa  193  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
342 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
342 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  36.61 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.14 
 
 
336 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.12 
 
 
342 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1193  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.76 
 
 
341 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.76 
 
 
357 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.76 
 
 
341 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.69 
 
 
341 aa  175  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>