109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0341 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 102 aa  213  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  88.12 
 
 		 103 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  86.27 
 
 		 103 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  73.27 
 
 		 100 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  68.32 
 
 		 100 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  57.84 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  56.86 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  58.82 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  56.44 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  54.74 
 
 		 96 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  54.08 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  55.1 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  52.04 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  55.79 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  54.74 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  50.53 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  50.53 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  50.53 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  49.47 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  48.45 
 
 		 214 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  52.58 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  50.5 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  48.51 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  48.51 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  46.81 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  44.68 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  44.21 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  42.55 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  42.55 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  42.55 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  41.49 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  40.21 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  41.49 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  39.33 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  39.13 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  43.21 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  40.74 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  36.84 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  35.79 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  37.11 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  36.17 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  36.17 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  36.17 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  38.75 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  35.64 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  35 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  35.42 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  34.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  35.42 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  36.05 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  37.65 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  37.66 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  29.87 
 
 		 106 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  36.47 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  36.47 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  34.88 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  29.87 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  34.69 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  34.38 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  29.87 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  35.53 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  34.69 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  30.93 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  31.68 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2905  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  29.17 
 
 		 96 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  31 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  27.27 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>