104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0280 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0280  protein of unknown function DUF86  100 
 
 
81 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0375  hypothetical protein  75.34 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0274  hypothetical protein  67.57 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3537  hypothetical protein  53.85 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134567  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0316  protein of unknown function DUF86  49.3 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1179  hypothetical protein  47.95 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0194477  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  45.71 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  37.5 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  38.57 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  40 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  37.14 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  37.14 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  32.88 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1935  protein of unknown function DUF86  45.16 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.336001  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  32.86 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0409  protein of unknown function DUF86  36.49 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0398458  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  38.67 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  37.7 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2423  hypothetical protein  38.16 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1925  hypothetical protein  39.71 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.248108  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  30.26 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1756  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.489985  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  35 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  31.88 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  38.71 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  36.49 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1732  protein of unknown function DUF86  36.84 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  28.77 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  36.49 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1474  protein of unknown function DUF86  43.86 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.173165  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  43.08 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3540  hypothetical protein  36.11 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279096  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  37.84 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  38.57 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  32.86 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  36.99 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1083  protein of unknown function DUF86  39.66 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.384095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0604  hypothetical protein  38.89 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  37.1 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  32.39 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  37.1 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  30.65 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  37.5 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  30.65 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  31.51 
 
 
113 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  37.1 
 
 
117 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  31.43 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  36.51 
 
 
116 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  30 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  37.14 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  37.14 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  34.43 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  33.87 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3961  hypothetical protein  35.82 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.626925  normal  0.333719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1103  hypothetical protein  31.75 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1297  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0872  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1947  protein of unknown function DUF86  36.51 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1958  protein of unknown function DUF86  36.51 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.323925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2071  protein of unknown function DUF86  35.82 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012332  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  30.56 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3145  protein of unknown function DUF86  33.85 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  34.29 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  29.58 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2417  hypothetical protein  40.62 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2482  hypothetical protein  28.77 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09367  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2706  hypothetical protein  45.65 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.733685  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  28.17 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  29.17 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  32.91 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0233  hypothetical protein  30.56 
 
 
118 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.473929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  33.85 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3940  protein of unknown function DUF86  30.99 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  35.38 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  32.43 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3032  hypothetical protein  32.26 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.488274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2149  protein of unknown function DUF86  35.38 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  26.76 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  27.27 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2968  protein of unknown function DUF86  28.17 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3141  protein of unknown function DUF86  28.17 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0685  hypothetical protein  30.65 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2871  protein of unknown function DUF86  28.12 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  0.932974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  32.39 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  29.17 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1653  hypothetical protein  33.78 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  33.87 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3906  protein of unknown function DUF86  36.36 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1293  protein of unknown function DUF86  32.26 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.053291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  33.87 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1202  hypothetical protein  31.58 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0520235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  27.14 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2671  hypothetical protein  34.33 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50240  hypothetical protein  35 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.753692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2886  hypothetical protein  33.85 
 
 
120 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.116499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>