More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0265 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  100 
 
 
645 aa  1291    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  65.77 
 
 
660 aa  826    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  69.55 
 
 
660 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  38.98 
 
 
636 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  34.73 
 
 
690 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  37.52 
 
 
654 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  36.59 
 
 
640 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  38.37 
 
 
634 aa  354  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  37.8 
 
 
651 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  40.54 
 
 
684 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  36.65 
 
 
759 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  36.69 
 
 
629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  38.95 
 
 
690 aa  302  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  36.54 
 
 
647 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  36.28 
 
 
629 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  34.41 
 
 
632 aa  289  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  33.62 
 
 
695 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.72 
 
 
635 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  33.94 
 
 
660 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  33.63 
 
 
695 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  36.48 
 
 
630 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  33.49 
 
 
645 aa  263  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  36.63 
 
 
635 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  35.27 
 
 
665 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.93 
 
 
656 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  32.54 
 
 
662 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  32.75 
 
 
667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  33.72 
 
 
673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  34.9 
 
 
662 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  33.08 
 
 
665 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  34.05 
 
 
662 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  30.63 
 
 
652 aa  246  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  32.88 
 
 
627 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  31.59 
 
 
628 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.22 
 
 
639 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  32.12 
 
 
671 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  36.03 
 
 
643 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  30.22 
 
 
642 aa  239  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  34.49 
 
 
658 aa  239  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  30.53 
 
 
660 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  33.09 
 
 
681 aa  234  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  33.22 
 
 
679 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  36.93 
 
 
679 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.53 
 
 
629 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.88 
 
 
660 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  31.77 
 
 
695 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  35.22 
 
 
683 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.87 
 
 
616 aa  231  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  31.81 
 
 
626 aa  230  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  33.57 
 
 
656 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  35.14 
 
 
675 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  33.69 
 
 
637 aa  221  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.76 
 
 
682 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  34.84 
 
 
647 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  32.06 
 
 
691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  31.1 
 
 
615 aa  217  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  36.56 
 
 
642 aa  217  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  30.95 
 
 
644 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  33.45 
 
 
690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.13 
 
 
675 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  32.93 
 
 
638 aa  210  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  43.82 
 
 
621 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  31.77 
 
 
695 aa  204  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  31.95 
 
 
678 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  30.04 
 
 
625 aa  198  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  31.4 
 
 
685 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  28.36 
 
 
614 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  29 
 
 
647 aa  197  7e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  30.21 
 
 
657 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  30.4 
 
 
657 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  28.12 
 
 
715 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  28.61 
 
 
658 aa  193  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  30.72 
 
 
777 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  28.94 
 
 
688 aa  187  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  28.06 
 
 
658 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.94 
 
 
658 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  29.38 
 
 
675 aa  185  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  29.9 
 
 
711 aa  184  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  34.13 
 
 
679 aa  181  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  37.64 
 
 
718 aa  181  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  29.34 
 
 
720 aa  177  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  34.98 
 
 
622 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  32.22 
 
 
760 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  30.66 
 
 
632 aa  173  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  29.43 
 
 
690 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  31.93 
 
 
696 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  31.27 
 
 
716 aa  171  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  34.46 
 
 
583 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  36.87 
 
 
710 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  36.87 
 
 
710 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  28.63 
 
 
726 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  29.44 
 
 
675 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  30.49 
 
 
726 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  29.66 
 
 
690 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  30.49 
 
 
726 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  30.73 
 
 
676 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0643  acyltransferase 3  28.45 
 
 
693 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  37.88 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  32.79 
 
 
675 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  30 
 
 
742 aa  157  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>