40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0195 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  99.62 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  63.26 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  52.71 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  53.49 
 
 		 268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  49.41 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  50.59 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  49.6 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  49.8 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  40.91 
 
 		 270 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  35.06 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  40.4 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  30.38 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  38.79 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  31.87 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  35.95 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  37.05 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  36.2 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  36.2 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  33.59 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  34.25 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  34.25 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  34.25 
 
 		 302 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  34.25 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  34.25 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  33.79 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  32.68 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  37.86 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  33.2 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  34.43 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  34.5 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  32.34 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3224  aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437912  hitchhiker  0.00000286784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1330  aminoglycoside phosphotransferase  25.68 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3169  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 409 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.132003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.77 
 
 		 353 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 		 443 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>