More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0164 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
458 aa  920    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  88.34 
 
 
423 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  85.15 
 
 
451 aa  793    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  70.18 
 
 
440 aa  634    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  93.23 
 
 
457 aa  858    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  92.05 
 
 
452 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  94.32 
 
 
456 aa  871    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  87.34 
 
 
451 aa  776    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  71.1 
 
 
440 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  69.61 
 
 
446 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  69.02 
 
 
440 aa  625  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  68.79 
 
 
440 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  69.02 
 
 
440 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  70.28 
 
 
444 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  68.61 
 
 
453 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  68.39 
 
 
447 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  68.93 
 
 
445 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  59.96 
 
 
440 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  59.96 
 
 
440 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  59.2 
 
 
444 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  66 
 
 
444 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  60.77 
 
 
440 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  59.68 
 
 
444 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  59.42 
 
 
442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  61.43 
 
 
424 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  61.43 
 
 
424 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  60.5 
 
 
434 aa  478  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  58.62 
 
 
440 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  55.91 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  54.3 
 
 
445 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  56.02 
 
 
449 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  56.72 
 
 
448 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  54.71 
 
 
441 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  53.76 
 
 
448 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  53.01 
 
 
445 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  53.57 
 
 
432 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.77 
 
 
439 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  51.18 
 
 
463 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  52.79 
 
 
438 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 
438 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.81 
 
 
438 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51.98 
 
 
480 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  52.14 
 
 
462 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.81 
 
 
438 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  47.88 
 
 
461 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 
441 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  48.4 
 
 
443 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.42 
 
 
443 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  51.27 
 
 
437 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  46.89 
 
 
444 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  45.97 
 
 
476 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  50.39 
 
 
455 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 
468 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  49.43 
 
 
468 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 
428 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  48.05 
 
 
481 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  50.63 
 
 
462 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  54.34 
 
 
449 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 
438 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  47.06 
 
 
446 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.34 
 
 
452 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  52.65 
 
 
439 aa  363  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  53.57 
 
 
472 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  48.99 
 
 
437 aa  361  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  49.36 
 
 
439 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.52 
 
 
439 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50.77 
 
 
445 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  51.34 
 
 
457 aa  358  8e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  51.63 
 
 
483 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 
444 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  46.49 
 
 
444 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  47.56 
 
 
426 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
436 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  46.22 
 
 
445 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  46.22 
 
 
445 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  50.66 
 
 
445 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
436 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  48.05 
 
 
440 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  50.54 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.41 
 
 
441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  50.54 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  47.56 
 
 
480 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  49.63 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  51.15 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  49.74 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  47.75 
 
 
479 aa  336  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  48.08 
 
 
490 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  48.21 
 
 
478 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  46.68 
 
 
478 aa  332  6e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  45.85 
 
 
444 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  46.68 
 
 
478 aa  332  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  48.21 
 
 
479 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  47.19 
 
 
457 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  47.7 
 
 
479 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 
477 aa  330  4e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 
455 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  44.87 
 
 
478 aa  329  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 
498 aa  327  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  46.35 
 
 
477 aa  324  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  50.15 
 
 
434 aa  323  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>