More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0144 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  100 
 
 		 156 aa  314  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  77.56 
 
 		 156 aa  249  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  68.83 
 
 		 155 aa  228  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  69.01 
 
 		 157 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  52.35 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  51.68 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  46.81 
 
 		 170 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  46.9 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  42.66 
 
 		 170 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  41.96 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  43.24 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  40.14 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  34.03 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  35.66 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.78 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  33.1 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  32.41 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  34.97 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  39.1 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  38.03 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  37.06 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  34.48 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  35.25 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  37.32 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  34.53 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  35.92 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  35.25 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  35 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.69 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  34.53 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  33.1 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  34.53 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  31.72 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.53 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  33.8 
 
 		 179 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  38.13 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  38.13 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  38.46 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  38.46 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.81 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.81 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  32.37 
 
 		 179 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.68 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  32.86 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  34.59 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.21 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  32.14 
 
 		 185 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  36.96 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40.62 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  36.17 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  32.14 
 
 		 185 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  40.62 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  38.35 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  29.8 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  31.69 
 
 		 163 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  32.19 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  33.83 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.23 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.01 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  38.28 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.11 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  34.97 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  34.29 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.33 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.48 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  36.15 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  27.46 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  27.46 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  36.64 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.72 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  28.17 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  31.69 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  27.46 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  27.46 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  27.46 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  35.21 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  29.58 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.91 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.92 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  34.06 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  33.59 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  32.86 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.27 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  36.99 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.38 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  29.73 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  33.1 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.87 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.94 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  28.38 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>