More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0099 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 408 aa  807    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  77.54 
 
 		 381 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  61.64 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  56.04 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  52.91 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3560  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.43 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  51.77 
 
 		 426 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.53 
 
 		 436 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  50.69 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.09 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.39 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  42.37 
 
 		 369 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2649  RND family efflux transporter MFP subunit  43.86 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  42.2 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.07 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  39.53 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  39.02 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  38.73 
 
 		 411 aa  219  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  37.31 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  36.69 
 
 		 368 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  36.44 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  35.74 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  37.26 
 
 		 412 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  34.12 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  37.31 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.25 
 
 		 410 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  34.46 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.13 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  37.15 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  34.13 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 399 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.44 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  35.69 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.09 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  35.18 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  38.07 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 408 aa  176  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  33.82 
 
 		 427 aa  176  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  34.28 
 
 		 428 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  36.06 
 
 		 396 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  35.2 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  38.07 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  34.05 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.23 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  36.07 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  31.78 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2029  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.59 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.109803  hitchhiker  0.00040221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  35.1 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  35.44 
 
 		 412 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  33.95 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.59 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  36.77 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.04 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.59 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  35.88 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.87 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  36.77 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  35.36 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  35.29 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  35.12 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  36.53 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  36.49 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  36.04 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.06 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  35.47 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  35.16 
 
 		 412 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  32.77 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.06 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.79 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  34.37 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  31.47 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  35.36 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  33.68 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.68 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  35.38 
 
 		 412 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 		 399 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 447 aa  166  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>