15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0092 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  66.67 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  83.67 
 
 		 72 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  69.39 
 
 		 74 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  48.48 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  59.09 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  69.05 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  41.56 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  55.56 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  49.15 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  44.44 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  36.92 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>