More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0081 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 506 aa  999    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  72.08 
 
 		 507 aa  743    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  82.02 
 
 		 505 aa  823    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  75.25 
 
 		 506 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  80.24 
 
 		 505 aa  809    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  73.47 
 
 		 507 aa  741    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  68.38 
 
 		 509 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  52.5 
 
 		 523 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  50.1 
 
 		 523 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  51.79 
 
 		 529 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  49.8 
 
 		 540 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  50 
 
 		 549 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  50.4 
 
 		 542 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  50.49 
 
 		 529 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  48.36 
 
 		 562 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  44.49 
 
 		 503 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  45.88 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  46.28 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  46.08 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  44.11 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  48.52 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  44.78 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  40.93 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  44.69 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  45.55 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  42.46 
 
 		 362 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  38.57 
 
 		 472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  41.79 
 
 		 358 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  38.2 
 
 		 363 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  37.1 
 
 		 323 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  40.84 
 
 		 342 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  37.61 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 		 365 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  41.04 
 
 		 341 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 		 328 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  40.63 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  35.34 
 
 		 327 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  35.9 
 
 		 328 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  35.9 
 
 		 340 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  36.52 
 
 		 332 aa  157  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  35.51 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  39.11 
 
 		 349 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  39.11 
 
 		 349 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  39.11 
 
 		 349 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  39.11 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  39.11 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  38.75 
 
 		 349 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  34.75 
 
 		 330 aa  143  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  33.86 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  33.44 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  33.75 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 		 344 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  34.58 
 
 		 339 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  34.28 
 
 		 346 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  36.51 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 345 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 		 344 aa  137  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 339 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4063  aminoglycoside phosphotransferase  36.5 
 
 		 308 aa  136  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  30.5 
 
 		 379 aa  136  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 		 338 aa  134  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  36.5 
 
 		 363 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  33.22 
 
 		 348 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  30.99 
 
 		 379 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 		 333 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 		 341 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  30.98 
 
 		 339 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  33.12 
 
 		 362 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  28.9 
 
 		 334 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  33.87 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  34.6 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  32.75 
 
 		 341 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  34.71 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  37.74 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  37.74 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  37.74 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  37.74 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  37.74 
 
 		 344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  29.31 
 
 		 325 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  34.64 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 		 348 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  37.36 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  37.88 
 
 		 401 aa  126  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  33.83 
 
 		 336 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  36.98 
 
 		 344 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  34.31 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 393 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 		 387 aa  123  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  31.87 
 
 		 391 aa  123  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  29 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 		 360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>