86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0049 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  79.13 
 
 
221 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  73.97 
 
 
219 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  76.53 
 
 
225 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  69.67 
 
 
228 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  70.97 
 
 
225 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  68.14 
 
 
227 aa  238  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  52.02 
 
 
230 aa  154  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  41.67 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  37.44 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  43.14 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  39.77 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  38.33 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  36.88 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  36.54 
 
 
197 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  31.15 
 
 
285 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  37.84 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  38.75 
 
 
211 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  35.79 
 
 
186 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  37.89 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.12 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  39.07 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  36.08 
 
 
186 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  38.51 
 
 
204 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  36.05 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  36.2 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  35.29 
 
 
163 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  35.29 
 
 
163 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  32.42 
 
 
160 aa  85.5  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  35.29 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  32.67 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  31.03 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  27.81 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  31.72 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  29.47 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  31.13 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.13 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.13 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  27.92 
 
 
161 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  34.06 
 
 
323 aa  63.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  32.3 
 
 
323 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  27.15 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  29.33 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.32 
 
 
170 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  27.22 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  30.2 
 
 
181 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  29.17 
 
 
169 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  29.03 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  27.71 
 
 
362 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  26.82 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.81 
 
 
179 aa  51.6  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  26.67 
 
 
167 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  26.95 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  24.05 
 
 
176 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  26.67 
 
 
180 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.67 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  27.67 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0677  OstA family protein  25.55 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.25138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  27.36 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0752  OstA family protein  25.55 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1350  OstA family protein  24.09 
 
 
153 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  27.08 
 
 
169 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  31.43 
 
 
705 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.48 
 
 
174 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  27.85 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.52 
 
 
162 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  27.61 
 
 
166 aa  45.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  28.45 
 
 
614 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.87 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  26.47 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  27.48 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  25.5 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.52 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.24 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.24 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  44.68 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.24 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.24 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.24 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.24 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.24 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  27.48 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  26.67 
 
 
175 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0666  OstA family protein  25.17 
 
 
154 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  25.83 
 
 
175 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  24.31 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>