254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0044 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  93.91 
 
 
230 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  92.17 
 
 
230 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  87.39 
 
 
230 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  83.91 
 
 
230 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  82.17 
 
 
230 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  81.74 
 
 
230 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.3 
 
 
280 aa  294  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.61 
 
 
229 aa  291  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  62.61 
 
 
230 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.04 
 
 
230 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  63.04 
 
 
230 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 
230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.04 
 
 
230 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  62.17 
 
 
230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  55.22 
 
 
230 aa  263  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  51.3 
 
 
230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.91 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  50.87 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  53.91 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  53.91 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  50.43 
 
 
230 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.87 
 
 
230 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  49.13 
 
 
230 aa  224  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  54.78 
 
 
229 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.74 
 
 
226 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  49.13 
 
 
222 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  48.26 
 
 
222 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.61 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  43.91 
 
 
221 aa  188  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.35 
 
 
222 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  41.74 
 
 
221 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  42.17 
 
 
221 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.61 
 
 
225 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  42.42 
 
 
223 aa  184  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  47.21 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.49 
 
 
252 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  41.82 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.59 
 
 
232 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.02 
 
 
223 aa  164  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  34.36 
 
 
217 aa  157  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  38.26 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  32.61 
 
 
221 aa  145  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  33.04 
 
 
225 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  26.57 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  27.5 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  26.5 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  26.5 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.99 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  28.5 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  26.5 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  27.6 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.5 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  25.12 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  27.23 
 
 
206 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
226 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  28.1 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.79 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  27.23 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  25.84 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  25.82 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  26.32 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.79 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.56 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  29.63 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  24.88 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.84 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.94 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  35.48 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.79 
 
 
203 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  25.93 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  26.89 
 
 
203 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  25.36 
 
 
203 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  30.23 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 
248 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  27.84 
 
 
212 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  24.88 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  28.11 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  29.36 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.36 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  24.59 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  24.88 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  24.88 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  30.15 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  28.45 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  24.04 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  29.44 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>