More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0006 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  75.82 
 
 		 159 aa  251  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  55.35 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  53.55 
 
 		 166 aa  166  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  52.26 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  47.77 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  49.03 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  50.32 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  43.33 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  44.87 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  43.33 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  43.33 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  44.03 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  47.86 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 181 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 181 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 181 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 181 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  39.39 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.71 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  43.59 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  38.69 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  38.69 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  38.1 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  38.1 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  38.1 
 
 		 222 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  38.1 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  38.22 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>