More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4586 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  75.25 
 
 
205 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  55.39 
 
 
203 aa  228  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.89 
 
 
378 aa  138  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.61 
 
 
378 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.13 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.64 
 
 
213 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 
214 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  36.63 
 
 
203 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  38.17 
 
 
207 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  33.92 
 
 
203 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  33.92 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.96 
 
 
196 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
411 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 
378 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.75 
 
 
203 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.75 
 
 
203 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.13 
 
 
382 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 
459 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.75 
 
 
205 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
209 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.16 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.16 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32.2 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.15 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
370 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 
445 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.32 
 
 
427 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 
440 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.16 
 
 
213 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.16 
 
 
442 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.45 
 
 
442 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
448 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
591 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.73 
 
 
442 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.48 
 
 
452 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
203 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
241 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
448 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.42 
 
 
369 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 
209 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.89 
 
 
442 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.2 
 
 
442 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 
226 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.89 
 
 
442 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
208 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 
226 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  29.74 
 
 
200 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 
201 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38.79 
 
 
210 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
256 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
447 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 
201 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.02 
 
 
200 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
200 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
214 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
213 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
209 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.7 
 
 
443 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34 
 
 
214 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
449 aa  98.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.57 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.66 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
204 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.82 
 
 
356 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 
363 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 
402 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.5 
 
 
200 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.5 
 
 
200 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
200 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
212 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.71 
 
 
207 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
447 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
218 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
212 aa  92.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 
383 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  26.71 
 
 
207 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35 
 
 
214 aa  92  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
233 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
202 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 
218 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
201 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>