More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4579 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
398 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  83.19 
 
 
371 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  66.29 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  58.07 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 
360 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.83 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
353 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  39.04 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  35.86 
 
 
770 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  31.42 
 
 
935 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  37.99 
 
 
399 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
382 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  33.73 
 
 
385 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
446 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
374 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
373 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
399 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
396 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
467 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
395 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
419 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
377 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
408 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
395 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
748 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  37.05 
 
 
388 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  32.43 
 
 
421 aa  106  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
374 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  37.45 
 
 
426 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.33 
 
 
382 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
440 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
359 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
433 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  33.94 
 
 
382 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
378 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
381 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  42.94 
 
 
370 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.49 
 
 
382 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
536 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
440 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
419 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
458 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
476 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  42.19 
 
 
385 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.52 
 
 
383 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
369 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
409 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
378 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
393 aa  102  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
415 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.87 
 
 
376 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.77 
 
 
381 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
423 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
407 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
377 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
380 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
417 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
425 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
406 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
379 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.11 
 
 
388 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 
364 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0054  glycosyl transferase group 1  38.83 
 
 
392 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 
362 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
380 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
370 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  38.21 
 
 
347 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 
374 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
408 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
408 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
408 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
367 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
404 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
421 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
425 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
412 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
412 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  37.43 
 
 
388 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
412 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
421 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 
382 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
373 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>