108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4571 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  82.73 
 
 
254 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  47.79 
 
 
235 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  46.25 
 
 
249 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  42.47 
 
 
261 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  37.67 
 
 
231 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  37.9 
 
 
225 aa  140  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  33.7 
 
 
238 aa  132  8e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 
251 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  32.47 
 
 
245 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 
222 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  39.11 
 
 
237 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  37.45 
 
 
258 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  36.4 
 
 
244 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  33.62 
 
 
259 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  34.78 
 
 
230 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  35.5 
 
 
222 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  34.42 
 
 
241 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  34.42 
 
 
241 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  31.12 
 
 
260 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  32.47 
 
 
240 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  35.62 
 
 
217 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  31.63 
 
 
230 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  32.84 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  28.99 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  28.99 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  1.36516e-06  unclonable  2.39983e-09 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  33.88 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  34.76 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  31.2 
 
 
232 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  30.81 
 
 
232 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  35.42 
 
 
200 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  35.39 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  35.39 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  31.76 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  35.23 
 
 
247 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  8.09595e-07  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  40.8 
 
 
229 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  31.67 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  35.59 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  40.65 
 
 
265 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  34.71 
 
 
259 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  34.71 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  35.59 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  30.59 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  34.12 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  31.43 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  33.7 
 
 
259 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  33.16 
 
 
226 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  1.32368e-06  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  33.92 
 
 
239 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  41.32 
 
 
245 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  35.09 
 
 
252 aa  85.1  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  31.63 
 
 
243 aa  84.7  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  31.63 
 
 
243 aa  84.7  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  35.09 
 
 
252 aa  85.1  1e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  2.13894e-05  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  37.4 
 
 
227 aa  84.3  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  33.54 
 
 
260 aa  84.3  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  35.71 
 
 
217 aa  83.2  4e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  29.95 
 
 
229 aa  83.2  5e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  33.2 
 
 
225 aa  82.4  8e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  34.92 
 
 
217 aa  82  9e-15  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  31.84 
 
 
281 aa  80.9  2e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  2.08542e-09 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  33.16 
 
 
212 aa  79.3  7e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  78.6  9e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 
210 aa  77  3e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  1.9093e-05  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  34.32 
 
 
227 aa  76.6  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  34.72 
 
 
235 aa  71.6  1e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  1.33784e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  31.38 
 
 
272 aa  67.4  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  30.11 
 
 
226 aa  65.5  9e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  31.21 
 
 
255 aa  65.5  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  35.26 
 
 
319 aa  61.2  2e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  28.35 
 
 
255 aa  61.2  2e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  61.2  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1875  hypothetical protein  29.75 
 
 
266 aa  60.1  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  33.15 
 
 
281 aa  57.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  32.64 
 
 
224 aa  55.8  7e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  28.96 
 
 
257 aa  55.8  7e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  53.9  2e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  34.13 
 
 
252 aa  54.7  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  30.46 
 
 
302 aa  53.1  4e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  37.88 
 
 
114 aa  52  1e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  27.22 
 
 
333 aa  52  1e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  29.14 
 
 
236 aa  50.8  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  32.69 
 
 
248 aa  51.2  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4445  hypothetical protein  36.04 
 
 
298 aa  50.4  3e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.434289  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  32.45 
 
 
285 aa  49.3  7e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  36.04 
 
 
264 aa  49.3  7e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  32.45 
 
 
334 aa  49.3  7e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  32.45 
 
 
249 aa  48.9  9e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  32.45 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  44.78 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  1.14136e-06 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2199  protein of unknown function DUF820  25.51 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53062e-05 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  37.65 
 
 
2196 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.29 
 
 
561 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1484  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
229 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.8309e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  30.97 
 
 
241 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  36.08 
 
 
314 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  38.03 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  31.82 
 
 
350 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0796  hypothetical protein  31.13 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  29.56 
 
 
402 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>