More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4547 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
470 aa  929    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  73.09 
 
 
449 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  42.55 
 
 
321 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  47.35 
 
 
415 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  48.98 
 
 
264 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  48.16 
 
 
280 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  48.16 
 
 
280 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  41.41 
 
 
319 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  40.38 
 
 
257 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  46.15 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  41.49 
 
 
320 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.46 
 
 
238 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  42.16 
 
 
305 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  38.98 
 
 
236 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  33.75 
 
 
361 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
313 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  39.53 
 
 
254 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  43.62 
 
 
394 aa  158  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  40.77 
 
 
419 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.57 
 
 
237 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  42.08 
 
 
256 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  42.08 
 
 
256 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  40.84 
 
 
256 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
238 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  42.98 
 
 
425 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  41.57 
 
 
597 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  43.33 
 
 
348 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  42.26 
 
 
395 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  37.45 
 
 
435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.54 
 
 
611 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  39.46 
 
 
445 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.89 
 
 
247 aa  153  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  39.24 
 
 
538 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  39.62 
 
 
267 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
270 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  40.17 
 
 
262 aa  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  39.44 
 
 
258 aa  151  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  40.71 
 
 
441 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  40.38 
 
 
256 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2128  protein serine/threonine phosphatase  40.73 
 
 
691 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.66852  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  34.43 
 
 
241 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
241 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  36.29 
 
 
417 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  37.01 
 
 
389 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  39.84 
 
 
474 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  38.68 
 
 
505 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.96 
 
 
245 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 
236 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  40.98 
 
 
469 aa  144  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.37 
 
 
271 aa  143  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  37.3 
 
 
269 aa  143  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  37.27 
 
 
422 aa  142  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  36.99 
 
 
245 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  39.84 
 
 
253 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 
271 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  39.04 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  38.67 
 
 
396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  37.55 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  37.85 
 
 
574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  39.11 
 
 
252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  36.14 
 
 
293 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
266 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  35.92 
 
 
558 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  37.76 
 
 
250 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 
386 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  37.77 
 
 
239 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  37.45 
 
 
466 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 
249 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  38.25 
 
 
244 aa  139  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  38.98 
 
 
478 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  36.51 
 
 
261 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  37.77 
 
 
239 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  33.33 
 
 
246 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  37.92 
 
 
247 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
252 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  38.15 
 
 
280 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  37.92 
 
 
247 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  40.59 
 
 
452 aa  139  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
540 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  38.31 
 
 
241 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  39.84 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 
567 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 
271 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  40.3 
 
 
449 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.82 
 
 
236 aa  136  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  37.35 
 
 
274 aa  136  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  39.43 
 
 
633 aa  136  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3469  protein serine/threonine phosphatase  37.59 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171174  normal  0.272032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  37.85 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3499  PASTA domain-containing protein  38.62 
 
 
583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  40.33 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
240 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.85 
 
 
261 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  31.13 
 
 
273 aa  134  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.98 
 
 
239 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  36.95 
 
 
259 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  34.75 
 
 
276 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  37.7 
 
 
296 aa  134  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.78 
 
 
280 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>