More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4527 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  87.22 
 
 		 673 aa  1154    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 671 aa  1314    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  52.3 
 
 		 652 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  51.27 
 
 		 662 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  35.5 
 
 		 650 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 		 773 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 		 666 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 		 775 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  36.12 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  36.48 
 
 		 762 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  35.98 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  37.79 
 
 		 771 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.6 
 
 		 567 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 		 665 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  34.93 
 
 		 684 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 		 666 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 		 674 aa  361  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 741 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 665 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 665 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.21 
 
 		 697 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 		 666 aa  346  8e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 672 aa  346  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 		 666 aa  339  9e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.71 
 
 		 671 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 665 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.78 
 
 		 670 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 		 658 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 664 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 636 aa  323  8e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.2 
 
 		 682 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.6 
 
 		 663 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  38.52 
 
 		 566 aa  317  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 		 693 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 656 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  38.81 
 
 		 575 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  38.03 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  37.2 
 
 		 567 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  37.2 
 
 		 568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  34.97 
 
 		 672 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  34.49 
 
 		 564 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 		 668 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  35.99 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 		 572 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  37.61 
 
 		 567 aa  298  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  35.47 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  36.19 
 
 		 606 aa  296  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  36.29 
 
 		 555 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 688 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  35.28 
 
 		 561 aa  295  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  36.05 
 
 		 624 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 		 664 aa  292  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  35.64 
 
 		 563 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 		 606 aa  291  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 		 666 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  36.15 
 
 		 585 aa  287  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  36.65 
 
 		 583 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 		 562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 		 565 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.1 
 
 		 588 aa  283  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 613 aa  282  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  34.38 
 
 		 562 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  34.23 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 		 659 aa  281  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 		 577 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  37.43 
 
 		 569 aa  280  7e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 		 565 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  37.7 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  34.43 
 
 		 564 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  34.96 
 
 		 563 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  31.75 
 
 		 650 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  31.77 
 
 		 649 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  36.89 
 
 		 607 aa  277  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  34.96 
 
 		 563 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  36.05 
 
 		 583 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.25 
 
 		 648 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  36.78 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  32.96 
 
 		 660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  35.46 
 
 		 569 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  31.83 
 
 		 648 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 		 595 aa  273  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 605 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 605 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  31.83 
 
 		 648 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 		 649 aa  273  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  34.96 
 
 		 562 aa  273  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  31.67 
 
 		 648 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  35.09 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  28.57 
 
 		 662 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  36.71 
 
 		 607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  34.45 
 
 		 678 aa  271  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  34.77 
 
 		 649 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 584 aa  270  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 659 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.91 
 
 		 648 aa  270  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  36.6 
 
 		 541 aa  270  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 668 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>