166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4523 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  100 
 
 		 206 aa  394  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  82.59 
 
 		 205 aa  300  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  50.79 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  54.8 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  51.05 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  49.21 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  51.01 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  47.42 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  44.95 
 
 		 197 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  46.77 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  43.5 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  47.15 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  41.84 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  42.78 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  42.63 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  37.36 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  43.16 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  48.78 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.29 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  42.46 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  43.32 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  39.58 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  39.58 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  39.58 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  38.95 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  43.32 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  48.26 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  38.1 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  37.5 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.72 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  40.48 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  42.05 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.53 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  36 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  36.05 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  38.2 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  38.76 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  38.76 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  37.64 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.67 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  37.5 
 
 		 182 aa  87.8  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  36.93 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  36.78 
 
 		 184 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  40.54 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  39.87 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  40 
 
 		 208 aa  84.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  38.06 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.51 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  42.65 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  37.06 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  38.06 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  43.4 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  37.3 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  35.76 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  36.84 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.41 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  42.14 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  42.55 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  41.18 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  30.51 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  32.14 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  32.03 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  37.96 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  34.16 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.16 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  39.88 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  40.56 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.86 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  38.26 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  38.32 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  42.34 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  32.61 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  37.65 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  36.94 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  34.1 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  34.15 
 
 		 182 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  39.13 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  37.41 
 
 		 169 aa  72  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  37.41 
 
 		 169 aa  72  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  53.25 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.1 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1274  BioY protein  43.62 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  33.91 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  36.36 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  32.26 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  45.63 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  39.49 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  33.7 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  27.92 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  27.92 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  31 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  39.16 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  37.32 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  34.07 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  33.33 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  32.61 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  33.73 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  34.16 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>